More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3789 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
272 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  47.83 
 
 
285 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  47.22 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  49.02 
 
 
297 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  41.9 
 
 
285 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  49.75 
 
 
349 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  43.56 
 
 
260 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  41.03 
 
 
267 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  44.49 
 
 
268 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  38.8 
 
 
281 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  41.74 
 
 
285 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  37.6 
 
 
312 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  41.28 
 
 
250 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  42.55 
 
 
261 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  39.17 
 
 
253 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  42.11 
 
 
267 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  39.71 
 
 
257 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  35.78 
 
 
254 aa  135  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  36.54 
 
 
237 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  36.84 
 
 
254 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  36.84 
 
 
254 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  36.54 
 
 
237 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  36.84 
 
 
254 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  33.91 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  34.1 
 
 
254 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  33.91 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  34.32 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  35.48 
 
 
270 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  35.48 
 
 
270 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  35.48 
 
 
270 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  34.39 
 
 
265 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  34.3 
 
 
256 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  33.94 
 
 
265 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  34.3 
 
 
256 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  34.3 
 
 
256 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  34.13 
 
 
255 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  33.49 
 
 
270 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  32.89 
 
 
256 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  33.94 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  32.21 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  32.26 
 
 
255 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  32.39 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  32.39 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  33.76 
 
 
262 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  33.94 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  31.6 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  32.39 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  32.23 
 
 
266 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  32.23 
 
 
266 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  32.23 
 
 
266 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  32.23 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  34.86 
 
 
269 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  35.29 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  35.29 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  35.29 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  30.14 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  32.65 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  31.05 
 
 
249 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  33.47 
 
 
269 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  33.17 
 
 
246 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  29.44 
 
 
255 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17511  putative transporter, membrane component  29.33 
 
 
249 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0895  putative transporter, membrane component  29.33 
 
 
249 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.378431  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  30.95 
 
 
266 aa  96.3  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13781  putative transporter, membrane component  28.57 
 
 
248 aa  95.5  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.539878  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05671  putative transporter, membrane component  30.69 
 
 
248 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  28.9 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  30.58 
 
 
258 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  30.53 
 
 
263 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  29.56 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  30.58 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  29.36 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  28.79 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  28.51 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  32.99 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  28.23 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1422  putative transporter, membrane component  30.73 
 
 
251 aa  88.6  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15241  putative transporter, membrane component  29.69 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0680677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2252  protein of unknown function DUF140  30.05 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15101  putative transporter, membrane component  29.69 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  29.08 
 
 
264 aa  87  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0442  putative ABC transport system permease protein  30.54 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  31.28 
 
 
396 aa  86.7  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0663  hypothetical protein  28.84 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680896  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1694  protein of unknown function DUF140  28.9 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  31.28 
 
 
372 aa  86.3  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  32.61 
 
 
259 aa  86.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  28.84 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  31.22 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  29.38 
 
 
378 aa  86.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  31.32 
 
 
251 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  29.38 
 
 
378 aa  86.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14851  putative transporter, membrane component  27.19 
 
 
251 aa  85.5  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  32.29 
 
 
248 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  30.77 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  30.77 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  28.27 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1737  protein of unknown function DUF140  29.3 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  32.06 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  31.5 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>