66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1565 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1565  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  513  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  69.55 
 
 
245 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2070  Cell division initiation protein-like protein  69.39 
 
 
277 aa  335  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  65.84 
 
 
245 aa  328  7e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1947  hypothetical protein  64.2 
 
 
245 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1927  hypothetical protein  64.2 
 
 
245 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1993  hypothetical protein  64.2 
 
 
245 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.767825  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4194  hypothetical protein  67.08 
 
 
245 aa  322  5e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.928565  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1880  Cell division initiation protein-like protein  56.56 
 
 
250 aa  257  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108649  normal  0.0180201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5967  putative cell division initiation protein  56.22 
 
 
238 aa  245  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09460  cell division initiation protein  50.81 
 
 
229 aa  225  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.166584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4032  large Ala/Glu-rich protein  36.17 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1036  hypothetical protein  27.21 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1980  hypothetical protein  34.78 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1283  hypothetical protein  38.78 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2119  hypothetical protein  43.82 
 
 
173 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1173  hypothetical protein  31.71 
 
 
165 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000597335 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14971  hypothetical protein  22.34 
 
 
311 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1698  hypothetical protein  33.91 
 
 
176 aa  62.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.947844  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1577  hypothetical protein  39.33 
 
 
162 aa  62.4  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.109089 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1366  hypothetical protein  29.03 
 
 
339 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.314555 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0626  hypothetical protein  24.14 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0610  hypothetical protein  24.14 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1112  hypothetical protein  29.49 
 
 
310 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1373  hypothetical protein  29.59 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00373296  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1513  hypothetical protein  32.14 
 
 
177 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11260  hypothetical protein  24.78 
 
 
175 aa  55.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0258387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1670  hypothetical protein  30 
 
 
170 aa  53.9  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.164163  hitchhiker  0.00970927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  40.62 
 
 
351 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3829  hypothetical protein  30.77 
 
 
177 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000108356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1879  H+-ATPase subunit H  26.62 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0616182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  39.42 
 
 
272 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  37.17 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  39 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1228  hypothetical protein  20.72 
 
 
152 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  31.62 
 
 
684 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  38.46 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  43.08 
 
 
452 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  38.46 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0789  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  36.84 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.248955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0763  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  28.57 
 
 
149 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  38 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0741  hypothetical protein  27.93 
 
 
170 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1135  hypothetical protein  45.83 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00586162  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8022  hypothetical protein  45.16 
 
 
405 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3309  hypothetical protein  23.21 
 
 
208 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3698  hypothetical protein  24.62 
 
 
154 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0217096  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0902  hypothetical protein  28.57 
 
 
181 aa  46.6  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0114  hypothetical protein  28.43 
 
 
148 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.234504  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1143  vacuolar-type H+-ATPase subunit H  24.42 
 
 
145 aa  46.6  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  33.77 
 
 
281 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1735  hypothetical protein  23.58 
 
 
154 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.895417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1323  hypothetical protein  23.66 
 
 
222 aa  45.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0994176  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2276  hypothetical protein  29.66 
 
 
179 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2611  hypothetical protein  27.43 
 
 
139 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  37.25 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  31.48 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1606  hypothetical protein  31.37 
 
 
168 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182766  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  31.43 
 
 
289 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  34.23 
 
 
510 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  26.72 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2296  hypothetical protein  45.24 
 
 
166 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0824729  hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1648  hypothetical protein  22.81 
 
 
152 aa  42.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0857  hypothetical protein  29.66 
 
 
165 aa  42  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  36.36 
 
 
292 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>