23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1263 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1263  myosin  100 
 
 		 348 aa  677    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0914958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  33.93 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  36.06 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1948  hypothetical protein  50 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503185  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3105  hypothetical protein  27.73 
 
 		 510 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00284275  hitchhiker  0.0000774683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  37.95 
 
 		 420 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11699  hypothetical protein  31.98 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.21007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31950  hypothetical protein  29 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.132693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26990  hypothetical protein  31.98 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0992393  normal  0.928887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5974  hypothetical protein  38.05 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  36.72 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3398  hypothetical protein  31.66 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  39.62 
 
 		 452 aa  52.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  31.35 
 
 		 428 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  30.28 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  31.43 
 
 		 680 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0584  hypothetical protein  28.24 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  27.17 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  32.75 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1279  putative cellulose-binding protein  36.07 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.97618  normal  0.555046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3956  hypothetical protein  38.95 
 
 		 272 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35260  hypothetical protein  35.37 
 
 		 241 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  26.5 
 
 		 497 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>