43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1137 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  100 
 
 		 134 aa  263  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  52.67 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  52.67 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  58.41 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  52.67 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  48.15 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  48.89 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  46.72 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  54.9 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  48.39 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3456  membrane protein  44.26 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  43.81 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06260  predicted membrane protein  54.03 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  46.36 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  41.59 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  37.5 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  36.73 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  38 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  35.51 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  36.96 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  38.53 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53830  hypothetical protein  43.84 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.623323  normal  0.810149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  33.93 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  36.28 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  41.12 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  31.63 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0720  hypothetical protein  38.24 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4712  hypothetical protein  37.72 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  31.78 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  31.78 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  35.71 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17130  predicted membrane protein  42.86 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  32.22 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0550  hypothetical protein  36.23 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.34704  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2608  hypothetical protein  36.26 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4279  membrane protein-like protein  33.61 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.566511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5136  hypothetical protein  38.71 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15890  hypothetical protein  40.51 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0572  hypothetical protein  34.78 
 
 		 88 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100695  hitchhiker  0.0053973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0560  hypothetical protein  34.78 
 
 		 88 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5367  hypothetical protein  34.11 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2375  DoxX family protein  32.58 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.182096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>