33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0913 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0913  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 467 aa  917    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  32.38 
 
 		 445 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  26.68 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  29.8 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  31.76 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0654  phage shock protein C, PspC  24.66 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19259  normal  0.260983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  25.87 
 
 		 555 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  41.43 
 
 		 107 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  46.15 
 
 		 165 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  53.33 
 
 		 143 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  37.93 
 
 		 129 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  22.29 
 
 		 511 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 346 aa  47.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  40.82 
 
 		 61 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  36 
 
 		 79 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  42.55 
 
 		 92 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  32.91 
 
 		 82 aa  45.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01874  hypothetical protein  46 
 
 		 129 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 127 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 398 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  40.68 
 
 		 85 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.43 
 
 		 86 aa  44.3  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  42 
 
 		 138 aa  44.3  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  44 
 
 		 129 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  42.55 
 
 		 81 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  36.84 
 
 		 68 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 		 127 aa  44.3  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  27.07 
 
 		 547 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 110 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 110 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 110 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>