89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0160 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0160  SpoIID/LytB domain protein  100 
 
 		 735 aa  1398    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0197  SpoIID/LytB domain protein  48.75 
 
 		 538 aa  318  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3764  Stage II sporulation D domain protein  54.33 
 
 		 305 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2562  SpoIID/LytB domain protein  39.05 
 
 		 711 aa  179  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1742  SpoIID/LytB domain protein  32.98 
 
 		 1032 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.334202  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3515  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.4 
 
 		 417 aa  109  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3325  SpoIID/LytB domain protein  31.06 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  29.46 
 
 		 664 aa  103  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  30.1 
 
 		 658 aa  104  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  33.33 
 
 		 382 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  34.82 
 
 		 386 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  32.34 
 
 		 407 aa  95.5  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.42 
 
 		 762 aa  91.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  35.35 
 
 		 432 aa  92  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  29.66 
 
 		 720 aa  90.9  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  32.47 
 
 		 382 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  32.47 
 
 		 382 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  33 
 
 		 391 aa  87  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  33.84 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0423  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.59 
 
 		 874 aa  85.5  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  33.33 
 
 		 625 aa  85.1  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  32.32 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  30.29 
 
 		 363 aa  84  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  29.61 
 
 		 443 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  30.27 
 
 		 437 aa  83.6  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  29.72 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.98 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.06 
 
 		 570 aa  77.8  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  29.78 
 
 		 546 aa  77  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.52 
 
 		 563 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3924  SpoIID/LytB domain protein  34.71 
 
 		 385 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.68 
 
 		 381 aa  73.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.08 
 
 		 450 aa  72  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  32.37 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3516  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.75 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395266  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.13 
 
 		 2449 aa  71.2  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  32.34 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  42.62 
 
 		 508 aa  69.7  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  30.66 
 
 		 495 aa  69.7  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.72 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  27.03 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.01 
 
 		 686 aa  67  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  26.88 
 
 		 708 aa  67  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1838  SpoIID/LytB domain protein  24.94 
 
 		 871 aa  66.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3805  sporulation stage II protein D  30.23 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  26.23 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.19 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1599  hypothetical protein  39.32 
 
 		 361 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.899582  normal  0.526265 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05351  sporulation protein SpoIID  32.7 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  31.48 
 
 		 526 aa  62.4  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3624  SpoIID/LytB domain protein  29.61 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000549962  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  36.11 
 
 		 383 aa  62  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  38.74 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.21 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0502  SpoIID/LytB domain protein  30.68 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  35.88 
 
 		 463 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  29.71 
 
 		 339 aa  60.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  29.24 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  26.56 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  30.1 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  29.77 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0757  amidase enhancer  38.68 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  29.09 
 
 		 339 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14861  hypothetical protein  38 
 
 		 275 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0533  stage II sporulation protein D-like  30.05 
 
 		 489 aa  57  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2597  SpoIID/LytB domain protein  37.9 
 
 		 493 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  29.41 
 
 		 321 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0712  SpoIID/LytB domain protein  41.82 
 
 		 586 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  29.28 
 
 		 339 aa  55.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  29.28 
 
 		 339 aa  55.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  28.64 
 
 		 339 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3479  SpoIID/LytB domain-containing protein  35.2 
 
 		 852 aa  55.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00505256  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  28.04 
 
 		 339 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  30.29 
 
 		 405 aa  54.7  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  30.29 
 
 		 405 aa  54.3  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  28.97 
 
 		 339 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4505  SpoIID/LytB domain protein  37.96 
 
 		 537 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  28.89 
 
 		 369 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  28.04 
 
 		 339 aa  53.9  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4443  SpoIID/LytB domain protein  37.96 
 
 		 537 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  27.78 
 
 		 369 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  28.33 
 
 		 376 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4348  SpoIID/LytB domain protein  37.5 
 
 		 530 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  47.37 
 
 		 2397 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1045  amidase enhancer-like  36.22 
 
 		 523 aa  49.7  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1304  SpoIID/LytB domain protein  42.86 
 
 		 291 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1405  SpoIID/LytB domain protein  42.86 
 
 		 291 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1318  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.33 
 
 		 259 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0300533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2545  stage II sporulation-related protein  42.86 
 
 		 291 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>