87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3764 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3764  Stage II sporulation D domain protein  100 
 
 		 305 aa  600  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0160  SpoIID/LytB domain protein  54.67 
 
 		 735 aa  308  8e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0197  SpoIID/LytB domain protein  44.52 
 
 		 538 aa  195  8.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  33.44 
 
 		 664 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3325  SpoIID/LytB domain protein  34.66 
 
 		 377 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  32.75 
 
 		 658 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2562  SpoIID/LytB domain protein  34.42 
 
 		 711 aa  82.4  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  26.72 
 
 		 762 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  36.76 
 
 		 720 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3515  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.92 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  30.34 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1742  SpoIID/LytB domain protein  32.1 
 
 		 1032 aa  72.4  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.334202  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  38.33 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0423  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.65 
 
 		 874 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  37.5 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  37.5 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  42.31 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  37.5 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  37.72 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  39.09 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3924  SpoIID/LytB domain protein  41.58 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  36.75 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  36.75 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  40.86 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1838  SpoIID/LytB domain protein  31.92 
 
 		 871 aa  65.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  35.33 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  42.2 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  37.5 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3516  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.93 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395266  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2014  SpoIID/LytB domain protein  41.03 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2039  SpoIID/LytB domain protein  41.03 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000207562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0700  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.45 
 
 		 503 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1599  hypothetical protein  37.61 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.899582  normal  0.526265 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  39.34 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  33.87 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  36.7 
 
 		 708 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  37.19 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0502  SpoIID/LytB domain protein  32.86 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  36.27 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  40.8 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  37.12 
 
 		 526 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14861  hypothetical protein  36.36 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0712  SpoIID/LytB domain protein  41.82 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.92 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  33.05 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.09 
 
 		 570 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  38.39 
 
 		 625 aa  56.6  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  31.91 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.29 
 
 		 563 aa  56.2  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.33 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  35.29 
 
 		 686 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.31 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  44.83 
 
 		 495 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  29.36 
 
 		 368 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  35.54 
 
 		 384 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2187  SpoIID/LytB domain protein  38 
 
 		 454 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  34.27 
 
 		 471 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1128  hypothetical protein  35.59 
 
 		 171 aa  53.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.834163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3624  SpoIID/LytB domain protein  36.19 
 
 		 459 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000549962  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4348  SpoIID/LytB domain protein  37.5 
 
 		 530 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.9 
 
 		 381 aa  52.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0757  amidase enhancer  36.54 
 
 		 555 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4505  SpoIID/LytB domain protein  36.54 
 
 		 537 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4443  SpoIID/LytB domain protein  36.54 
 
 		 537 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  31.2 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3479  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.77 
 
 		 852 aa  50.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00505256  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0180  SpoIID/LytB domain-containing protein  35.51 
 
 		 533 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0918  SpoIID/LytB domain-containing protein  39.22 
 
 		 536 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  51.06 
 
 		 450 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17760  sporulation stage II protein D  61.76 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.377102  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05351  sporulation protein SpoIID  41.74 
 
 		 472 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2597  SpoIID/LytB domain protein  35.71 
 
 		 493 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0085  stage II sporulation protein D  34.68 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.622828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  28.8 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  29.41 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  36.97 
 
 		 405 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2108  sporulation protein and related proteins  35.38 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0533  stage II sporulation protein D-like  40.52 
 
 		 489 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  29.06 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  36.67 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4925  SpoIID/LytB domain protein  46.81 
 
 		 558 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  29.47 
 
 		 381 aa  43.9  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0056  amidase enhancer  27.62 
 
 		 515 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0244  SpoIID/LytB domain protein  45.65 
 
 		 584 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  28.43 
 
 		 462 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0600  SpoIID/LytB domain protein  30.43 
 
 		 472 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.455802  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1045  amidase enhancer-like  51.52 
 
 		 523 aa  42.4  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.263222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>