127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2562 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2562  SpoIID/LytB domain protein  100 
 
 
711 aa  1411    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2561  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  87.58 
 
 
784 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2558  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  71.15 
 
 
728 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  52.23 
 
 
461 aa  274  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3274  hydrophobic protein  46.62 
 
 
347 aa  259  9e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1941  hypothetical protein  48.58 
 
 
537 aa  251  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1068  hydrophobic  47.87 
 
 
536 aa  240  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1206  hypothetical protein  40.54 
 
 
854 aa  226  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0160  SpoIID/LytB domain protein  39.27 
 
 
735 aa  194  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0423  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.72 
 
 
874 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0197  SpoIID/LytB domain protein  38.72 
 
 
538 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  36.78 
 
 
658 aa  167  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1742  SpoIID/LytB domain protein  36.22 
 
 
1032 aa  162  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.334202  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3515  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.93 
 
 
417 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  34.84 
 
 
664 aa  130  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2868  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.94 
 
 
540 aa  110  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  33.33 
 
 
546 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3325  SpoIID/LytB domain protein  28.39 
 
 
377 aa  100  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.44 
 
 
570 aa  97.8  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.6 
 
 
508 aa  96.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3516  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.99 
 
 
384 aa  92  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395266  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  28.78 
 
 
437 aa  89.7  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.59 
 
 
388 aa  89  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  32.09 
 
 
625 aa  88.6  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  30.04 
 
 
443 aa  87.4  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  30.32 
 
 
363 aa  87  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  31.65 
 
 
386 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2459  hypothetical protein  34.71 
 
 
438 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.218343  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3764  Stage II sporulation D domain protein  33.78 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  31.78 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  27.5 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  27.53 
 
 
471 aa  79  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.78 
 
 
450 aa  77.8  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  38.58 
 
 
762 aa  77.8  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  28.99 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  28.99 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  27.73 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  29.51 
 
 
339 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  25.58 
 
 
720 aa  73.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  29.51 
 
 
339 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  29.92 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  27.8 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  29.51 
 
 
339 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  26.5 
 
 
708 aa  72.8  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3479  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.43 
 
 
852 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00505256  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  29.22 
 
 
339 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  29.22 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  27 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  29.51 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  29.51 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05351  sporulation protein SpoIID  31.6 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  26.16 
 
 
381 aa  70.1  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  29.51 
 
 
339 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  29.51 
 
 
339 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  25.78 
 
 
391 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  29.88 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3805  sporulation stage II protein D  28.99 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2158  stage II sporulation protein D  23.05 
 
 
340 aa  67  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.69 
 
 
378 aa  67.4  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.1 
 
 
686 aa  66.6  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  28.35 
 
 
376 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2448  stage II sporulation protein D  23.05 
 
 
340 aa  65.1  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  31.2 
 
 
526 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  27.08 
 
 
384 aa  64.3  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  25 
 
 
391 aa  64.7  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  25.57 
 
 
397 aa  64.3  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0459  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.5 
 
 
1070 aa  63.9  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  26.57 
 
 
563 aa  63.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  25.32 
 
 
368 aa  63.9  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0533  stage II sporulation protein D-like  28.79 
 
 
489 aa  62.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  28.32 
 
 
383 aa  62.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4348  SpoIID/LytB domain protein  33.33 
 
 
530 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  26.95 
 
 
321 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0180  SpoIID/LytB domain-containing protein  25.93 
 
 
533 aa  62.4  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  26 
 
 
463 aa  62.4  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  27.61 
 
 
369 aa  61.2  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  29.96 
 
 
495 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3399  stage II sporulation protein D  27.69 
 
 
343 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  26.15 
 
 
421 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4443  SpoIID/LytB domain protein  36.36 
 
 
537 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0244  SpoIID/LytB domain protein  26.78 
 
 
584 aa  58.5  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4505  SpoIID/LytB domain protein  36.36 
 
 
537 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0700  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.73 
 
 
503 aa  58.5  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0918  SpoIID/LytB domain-containing protein  26.4 
 
 
536 aa  58.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478605  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  26.6 
 
 
369 aa  57.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  24.39 
 
 
369 aa  57.4  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  30 
 
 
366 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0712  SpoIID/LytB domain protein  33.57 
 
 
586 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0106  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.71 
 
 
347 aa  55.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0757  amidase enhancer  23.93 
 
 
555 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1128  hypothetical protein  33.85 
 
 
171 aa  54.3  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.834163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3624  SpoIID/LytB domain protein  27.14 
 
 
459 aa  54.3  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000549962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0281  stage II sporulation protein D  30.71 
 
 
341 aa  54.3  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213834  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  27.04 
 
 
405 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1599  hypothetical protein  31.94 
 
 
361 aa  53.5  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.899582  normal  0.526265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2597  SpoIID/LytB domain protein  28.5 
 
 
493 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2839  stage II sporulation protein D  29.37 
 
 
345 aa  53.5  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3287  stage II sporulation protein D  25.94 
 
 
342 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1838  SpoIID/LytB domain protein  29.12 
 
 
871 aa  53.5  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0059  amidase enhancer  33.6 
 
 
519 aa  53.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>