145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2621 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  100 
 
 		 321 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  76.56 
 
 		 376 aa  511  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  63.99 
 
 		 369 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  58.23 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  57.56 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  58.55 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  56.45 
 
 		 376 aa  344  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  38.87 
 
 		 508 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  36.56 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  36.56 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  34.24 
 
 		 386 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  35.48 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  33.56 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  34.16 
 
 		 526 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  29.91 
 
 		 720 aa  169  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  35.03 
 
 		 625 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  37.02 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  34.52 
 
 		 391 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  34.52 
 
 		 391 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  35.09 
 
 		 397 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  35.09 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  34.04 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  35.47 
 
 		 368 aa  155  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1318  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.98 
 
 		 259 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0300533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.19 
 
 		 570 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  31.85 
 
 		 407 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  36.15 
 
 		 437 aa  153  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1304  SpoIID/LytB domain protein  38.85 
 
 		 291 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.68 
 
 		 563 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2187  SpoIID/LytB domain protein  34.22 
 
 		 454 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1405  SpoIID/LytB domain protein  38.85 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0085  stage II sporulation protein D  34.69 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.622828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2545  stage II sporulation-related protein  38.85 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.9 
 
 		 381 aa  146  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.6 
 
 		 366 aa  146  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  33.21 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  32.25 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.37 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  29.39 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  32.25 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  32.25 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  32.85 
 
 		 380 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  32.25 
 
 		 339 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  32.97 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  32.97 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2839  stage II sporulation protein D  33.21 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  31.46 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  32.61 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  32.61 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.33 
 
 		 450 aa  139  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.58 
 
 		 388 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  32.61 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  30.88 
 
 		 471 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  29.79 
 
 		 432 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3147  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.33 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3805  sporulation stage II protein D  32.37 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0600  SpoIID/LytB domain protein  30.15 
 
 		 472 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.455802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2376  stage II sporulation protein D  32.22 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  27.68 
 
 		 546 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2135  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.63 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  28.25 
 
 		 708 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21150  SpoIID/LytB domain protein  29.59 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000468923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2374  sporulation protein and related proteins  33.33 
 
 		 326 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760464 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0689  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.64 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.531894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4162  stage II sporulation protein D  31.32 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000996783  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  30.03 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  30.03 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2616  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.19 
 
 		 334 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0221  SpoIID/LytB domain protein  29.84 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000520867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3287  stage II sporulation protein D  28.63 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1268  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.76 
 
 		 321 aa  119  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3399  stage II sporulation protein D  30.15 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0106  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.72 
 
 		 347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18691  putative amidase enhancer  29.72 
 
 		 517 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.835573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2108  sporulation protein and related proteins  31.11 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0117  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.37 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0244  SpoIID/LytB domain protein  33.47 
 
 		 584 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  31.54 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0281  stage II sporulation protein D  31.45 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3325  SpoIID/LytB domain protein  33.47 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17760  sporulation stage II protein D  29.96 
 
 		 319 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.377102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2158  stage II sporulation protein D  28.15 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0218  stage II sporulation protein D  27.94 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1752  putative amidase enhancer  27.73 
 
 		 517 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  29.73 
 
 		 495 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2448  stage II sporulation protein D  27.88 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3624  SpoIID/LytB domain protein  28.78 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000549962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0087  sporulation protein and related proteins  30.45 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00338057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0071  SpoIID/LytB domain protein  26.98 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000124334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05351  sporulation protein SpoIID  30.68 
 
 		 472 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18501  putative amidase enhancer  27.24 
 
 		 512 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  29.64 
 
 		 833 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0930  sporulation protein and related proteins  32.04 
 
 		 568 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0533  stage II sporulation protein D-like  32.74 
 
 		 489 aa  102  9e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.75 
 
 		 686 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4787  SpoIID/LytB domain protein  30.86 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2636  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.63 
 
 		 675 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3479  SpoIID/LytB domain-containing protein  40.62 
 
 		 852 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00505256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2752  SpoIID/LytB domain protein  31.25 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18501  putative amidase enhancer  28.62 
 
 		 511 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>