140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2187 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2187  SpoIID/LytB domain protein  100 
 
 		 454 aa  908    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  36.05 
 
 		 376 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  35 
 
 		 386 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.65 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  34.2 
 
 		 376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  32.1 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  34.22 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.43 
 
 		 508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  32.87 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.81 
 
 		 378 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  28.57 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.41 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  32.6 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  32.6 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  31.97 
 
 		 625 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  35.02 
 
 		 382 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  33.33 
 
 		 526 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.55 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  32.55 
 
 		 384 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.94 
 
 		 366 aa  129  9.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  31.8 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2374  sporulation protein and related proteins  34.97 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760464 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  28 
 
 		 720 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  30.3 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  29.59 
 
 		 369 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  26.67 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.39 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3805  sporulation stage II protein D  30.3 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  30.5 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0117  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.37 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  30.5 
 
 		 339 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3399  stage II sporulation protein D  32.63 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  29.43 
 
 		 339 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  29.23 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  29.43 
 
 		 339 aa  117  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  29.23 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  30.77 
 
 		 339 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  29.43 
 
 		 339 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  29.79 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0930  sporulation protein and related proteins  34.86 
 
 		 568 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000915589 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21150  SpoIID/LytB domain protein  31.01 
 
 		 316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000468923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3287  stage II sporulation protein D  31.14 
 
 		 342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2376  stage II sporulation protein D  31.52 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  26.29 
 
 		 570 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  29.72 
 
 		 339 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0085  stage II sporulation protein D  33.45 
 
 		 314 aa  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.622828  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0221  SpoIID/LytB domain protein  30.48 
 
 		 316 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000520867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  30.53 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0281  stage II sporulation protein D  28.52 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0087  sporulation protein and related proteins  30.15 
 
 		 309 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00338057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  29.67 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  33.66 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  32.35 
 
 		 363 aa  109  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3624  SpoIID/LytB domain protein  29.17 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000549962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  31.31 
 
 		 833 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  29.79 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  27.65 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  24.7 
 
 		 546 aa  106  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0700  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.01 
 
 		 503 aa  106  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.08 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2108  sporulation protein and related proteins  29.63 
 
 		 326 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17760  sporulation stage II protein D  31.31 
 
 		 319 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.377102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0106  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.64 
 
 		 347 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  28.24 
 
 		 471 aa  103  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0218  stage II sporulation protein D  28.98 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0689  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.74 
 
 		 326 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.531894  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.41 
 
 		 762 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2616  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.68 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1304  SpoIID/LytB domain protein  34.19 
 
 		 291 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1405  SpoIID/LytB domain protein  34.19 
 
 		 291 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2545  stage II sporulation-related protein  34.19 
 
 		 291 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  29.55 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1045  amidase enhancer-like  31.91 
 
 		 523 aa  98.2  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3147  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.07 
 
 		 320 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  29.79 
 
 		 495 aa  97.8  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.51 
 
 		 563 aa  97.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4348  SpoIID/LytB domain protein  32.54 
 
 		 530 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2135  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.16 
 
 		 322 aa  96.7  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4505  SpoIID/LytB domain protein  31.43 
 
 		 537 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  33.33 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4443  SpoIID/LytB domain protein  31.43 
 
 		 537 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0600  SpoIID/LytB domain protein  30.77 
 
 		 472 aa  94.4  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.455802  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1268  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.76 
 
 		 321 aa  94  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  27.52 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  27.52 
 
 		 405 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  29.07 
 
 		 443 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  26.69 
 
 		 708 aa  86.7  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2839  stage II sporulation protein D  27.46 
 
 		 345 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4162  stage II sporulation protein D  28.52 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000996783  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0757  amidase enhancer  30.91 
 
 		 555 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2158  stage II sporulation protein D  27.56 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3325  SpoIID/LytB domain protein  36.9 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4925  SpoIID/LytB domain protein  27.2 
 
 		 558 aa  83.2  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0918  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.94 
 
 		 536 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0180  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.79 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0712  SpoIID/LytB domain protein  27.38 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0533  stage II sporulation protein D-like  34.07 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2636  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.49 
 
 		 675 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1318  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.82 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0300533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2448  stage II sporulation protein D  27.54 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>