135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0117 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0117  SpoIID/LytB domain-containing protein  100 
 
 
317 aa  653    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0221  SpoIID/LytB domain protein  53.16 
 
 
316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000520867  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0087  sporulation protein and related proteins  52.19 
 
 
309 aa  319  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00338057  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1268  SpoIID/LytB domain-containing protein  40.38 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0689  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.54 
 
 
326 aa  229  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.531894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21150  SpoIID/LytB domain protein  37.95 
 
 
316 aa  209  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000468923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0071  SpoIID/LytB domain protein  39.07 
 
 
336 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000124334  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2108  sporulation protein and related proteins  37.27 
 
 
326 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2376  stage II sporulation protein D  30.03 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3805  sporulation stage II protein D  31.71 
 
 
337 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  34.33 
 
 
383 aa  136  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3147  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.88 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2616  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.91 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.87 
 
 
508 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0085  stage II sporulation protein D  29.72 
 
 
314 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.622828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0218  stage II sporulation protein D  29.15 
 
 
358 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  30.33 
 
 
339 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  30.24 
 
 
339 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  30.89 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  30.03 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  30.03 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  29.91 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2187  SpoIID/LytB domain protein  31.37 
 
 
454 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  29.73 
 
 
339 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  29.94 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  29.64 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  30.61 
 
 
391 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  29.61 
 
 
339 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  30.86 
 
 
526 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3399  stage II sporulation protein D  29.79 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  30.45 
 
 
376 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  32.12 
 
 
363 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  28.7 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  29.37 
 
 
321 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  28.72 
 
 
625 aa  112  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.29 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  27.27 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  29.59 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  30.63 
 
 
391 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0106  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.69 
 
 
347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.51 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0281  stage II sporulation protein D  28.86 
 
 
341 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213834  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  28.39 
 
 
432 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  30.15 
 
 
381 aa  107  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2839  stage II sporulation protein D  27.92 
 
 
345 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  28.79 
 
 
382 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  28.79 
 
 
382 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2135  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.33 
 
 
322 aa  105  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2158  stage II sporulation protein D  29.07 
 
 
340 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3287  stage II sporulation protein D  27.35 
 
 
342 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  26.22 
 
 
369 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  28.52 
 
 
386 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  29.81 
 
 
384 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2374  sporulation protein and related proteins  30.3 
 
 
326 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000760464 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4162  stage II sporulation protein D  31.4 
 
 
317 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000996783  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.2 
 
 
381 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  28.09 
 
 
368 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  27.14 
 
 
369 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0600  SpoIID/LytB domain protein  28.2 
 
 
472 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.455802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  29.71 
 
 
463 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  25.21 
 
 
443 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  27.88 
 
 
471 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2448  stage II sporulation protein D  28.37 
 
 
340 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  29.24 
 
 
397 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.84 
 
 
450 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18501  putative amidase enhancer  29.69 
 
 
512 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2545  stage II sporulation-related protein  25.47 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1405  SpoIID/LytB domain protein  25.47 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.37 
 
 
421 aa  93.2  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1304  SpoIID/LytB domain protein  25.47 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  30.89 
 
 
380 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  25.77 
 
 
708 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17760  sporulation stage II protein D  28.62 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.377102  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18501  putative amidase enhancer  27.99 
 
 
511 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1318  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.62 
 
 
259 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0300533  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4787  SpoIID/LytB domain protein  28.78 
 
 
313 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.02 
 
 
388 aa  85.9  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  30.87 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  27.84 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18691  putative amidase enhancer  29.35 
 
 
517 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.835573  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0059  amidase enhancer  27.56 
 
 
519 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  27.27 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  28.12 
 
 
405 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1752  putative amidase enhancer  29.69 
 
 
517 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17861  putative amidase enhancer  30.04 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  25.87 
 
 
563 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  28.43 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0056  amidase enhancer  27.56 
 
 
515 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3325  SpoIID/LytB domain protein  31.69 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4443  SpoIID/LytB domain protein  29.02 
 
 
537 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4505  SpoIID/LytB domain protein  29.02 
 
 
537 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  25.63 
 
 
546 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  24.76 
 
 
495 aa  76.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00621  putative amidase enhancer  29.33 
 
 
527 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0244  SpoIID/LytB domain protein  27.07 
 
 
584 aa  75.9  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0757  amidase enhancer  26.4 
 
 
555 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0700  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.88 
 
 
503 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4348  SpoIID/LytB domain protein  24.84 
 
 
530 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  25.35 
 
 
833 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.36 
 
 
762 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>