138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00621 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_00621  putative amidase enhancer  100 
 
 
527 aa  1051    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0056  amidase enhancer  57.62 
 
 
515 aa  528  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0059  amidase enhancer  59.59 
 
 
519 aa  525  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21291  putative amidase enhancer  52.4 
 
 
517 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0680822  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1258  putative amidase enhancer  52.19 
 
 
517 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17861  putative amidase enhancer  53.51 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18501  putative amidase enhancer  36.25 
 
 
511 aa  349  9e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18691  putative amidase enhancer  38.6 
 
 
517 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.835573  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18501  putative amidase enhancer  37.09 
 
 
512 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1752  putative amidase enhancer  37.58 
 
 
517 aa  309  9e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4505  SpoIID/LytB domain protein  34.99 
 
 
537 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4443  SpoIID/LytB domain protein  34.99 
 
 
537 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4348  SpoIID/LytB domain protein  36.15 
 
 
530 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0712  SpoIID/LytB domain protein  37.41 
 
 
586 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0180  SpoIID/LytB domain-containing protein  35.15 
 
 
533 aa  216  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1045  amidase enhancer-like  39.46 
 
 
523 aa  212  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0757  amidase enhancer  32.62 
 
 
555 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0918  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.82 
 
 
536 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478605  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4925  SpoIID/LytB domain protein  37.01 
 
 
558 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.99 
 
 
421 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  35.51 
 
 
380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  31.12 
 
 
363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  32.32 
 
 
407 aa  127  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  30.79 
 
 
708 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  32.33 
 
 
382 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  32.33 
 
 
382 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  28.05 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  28.04 
 
 
368 aa  117  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  30.82 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2616  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.37 
 
 
334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  31.65 
 
 
625 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  32.57 
 
 
382 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.82 
 
 
378 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2636  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.35 
 
 
675 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139287  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  29.84 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2838  SpoIID/LytB domain protein  35.56 
 
 
616 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  30.15 
 
 
526 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0117  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.33 
 
 
317 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2743  SpoIID/LytB domain protein  35.5 
 
 
612 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2653  sporulation protein, amidase enhancer  35.83 
 
 
612 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  26.81 
 
 
376 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  31.99 
 
 
384 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  22.17 
 
 
570 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  27.51 
 
 
391 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  23.95 
 
 
546 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.39 
 
 
381 aa  103  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  26.51 
 
 
391 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  25.93 
 
 
391 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.58 
 
 
388 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  30.95 
 
 
386 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  26.4 
 
 
381 aa  100  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.08 
 
 
369 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21150  SpoIID/LytB domain protein  26.6 
 
 
316 aa  97.8  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000468923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  28.43 
 
 
471 aa  95.9  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  24.5 
 
 
397 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  28.75 
 
 
369 aa  94.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0281  stage II sporulation protein D  27.85 
 
 
341 aa  94  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213834  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1405  SpoIID/LytB domain protein  33.1 
 
 
291 aa  93.2  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2545  stage II sporulation-related protein  32.04 
 
 
291 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1268  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.87 
 
 
321 aa  92  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.03 
 
 
686 aa  92.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1304  SpoIID/LytB domain protein  33.1 
 
 
291 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  26.2 
 
 
432 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2187  SpoIID/LytB domain protein  28.85 
 
 
454 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0218  stage II sporulation protein D  29.18 
 
 
358 aa  91.3  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2374  sporulation protein and related proteins  28.99 
 
 
326 aa  90.9  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000760464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.27 
 
 
508 aa  90.9  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  25.24 
 
 
383 aa  89.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0221  SpoIID/LytB domain protein  27.43 
 
 
316 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000520867  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0085  stage II sporulation protein D  32.12 
 
 
314 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.622828  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.19 
 
 
450 aa  88.2  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0689  SpoIID/LytB domain-containing protein  26.32 
 
 
326 aa  87.8  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.531894  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  25.44 
 
 
405 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  28.11 
 
 
437 aa  87.4  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0106  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.21 
 
 
347 aa  87.8  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  25.71 
 
 
405 aa  87.4  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3805  sporulation stage II protein D  27.15 
 
 
337 aa  87.4  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0244  SpoIID/LytB domain protein  29.33 
 
 
584 aa  86.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2108  sporulation protein and related proteins  26.41 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2376  stage II sporulation protein D  24.57 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440786  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0600  SpoIID/LytB domain protein  27.92 
 
 
472 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.455802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3287  stage II sporulation protein D  25.93 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  25.42 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17760  sporulation stage II protein D  27.74 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.377102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  25.42 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  26.1 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  25.08 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3147  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.06 
 
 
320 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  25.42 
 
 
339 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  25.08 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  25.42 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  25.08 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0087  sporulation protein and related proteins  27.56 
 
 
309 aa  82.8  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00338057  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  25.08 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0071  SpoIID/LytB domain protein  28.32 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000124334  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0700  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.25 
 
 
503 aa  81.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  25.08 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  22.92 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2158  stage II sporulation protein D  24.92 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  23.87 
 
 
563 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>