144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1599 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1599  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  712    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.899582  normal  0.526265 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2039  SpoIID/LytB domain protein  52.94 
 
 
378 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000207562  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2014  SpoIID/LytB domain protein  52.94 
 
 
378 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0502  SpoIID/LytB domain protein  51.04 
 
 
388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14861  hypothetical protein  63.25 
 
 
275 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.244523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3924  SpoIID/LytB domain protein  45.71 
 
 
385 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1128  hypothetical protein  57.93 
 
 
171 aa  193  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.834163  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1350  hypothetical protein  56.25 
 
 
263 aa  170  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  42.93 
 
 
407 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.17 
 
 
388 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  42.64 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  40.1 
 
 
381 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  42.27 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  38.04 
 
 
382 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  37.02 
 
 
382 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  37.02 
 
 
382 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  33.18 
 
 
443 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  37.04 
 
 
391 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  37.04 
 
 
391 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  33.65 
 
 
376 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  39.13 
 
 
391 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  43.36 
 
 
432 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.61 
 
 
369 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  40.18 
 
 
437 aa  95.5  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  42.86 
 
 
508 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  38.29 
 
 
471 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  40.32 
 
 
463 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.82 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  35.65 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  39.83 
 
 
383 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  32.68 
 
 
708 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  40.34 
 
 
369 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  38.35 
 
 
720 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  30 
 
 
366 aa  92  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  39.29 
 
 
363 aa  92  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  38.46 
 
 
321 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  39.5 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  40.34 
 
 
376 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.33 
 
 
686 aa  87  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  36.31 
 
 
625 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  36.84 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0533  stage II sporulation protein D-like  36.81 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0600  SpoIID/LytB domain protein  39.86 
 
 
472 aa  83.2  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.455802  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  41.84 
 
 
450 aa  82.8  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  32.26 
 
 
381 aa  82.8  0.000000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05351  sporulation protein SpoIID  41.8 
 
 
472 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  31.78 
 
 
526 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  35.59 
 
 
570 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.34 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  37.07 
 
 
762 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  40.16 
 
 
495 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  29.46 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3479  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.54 
 
 
852 aa  77  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00505256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  36.43 
 
 
380 aa  77  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2636  SpoIID/LytB domain-containing protein  39.74 
 
 
675 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139287  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  38.98 
 
 
563 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3325  SpoIID/LytB domain protein  43.1 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0712  SpoIID/LytB domain protein  32.86 
 
 
586 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  31.68 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0085  stage II sporulation protein D  33.96 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.622828  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  31.68 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4505  SpoIID/LytB domain protein  30.91 
 
 
537 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4443  SpoIID/LytB domain protein  30.91 
 
 
537 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0180  SpoIID/LytB domain-containing protein  40.21 
 
 
533 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4348  SpoIID/LytB domain protein  38.14 
 
 
530 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  39.02 
 
 
664 aa  66.2  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0244  SpoIID/LytB domain protein  33.62 
 
 
584 aa  66.2  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2597  SpoIID/LytB domain protein  39.5 
 
 
493 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0757  amidase enhancer  35.05 
 
 
555 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1037  hypothetical protein  32.89 
 
 
212 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0160  SpoIID/LytB domain protein  39.32 
 
 
735 aa  63.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1045  amidase enhancer-like  36.92 
 
 
523 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0700  SpoIID/LytB domain-containing protein  35.59 
 
 
503 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3515  SpoIID/LytB domain-containing protein  44.86 
 
 
417 aa  62.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  42.2 
 
 
658 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2653  sporulation protein, amidase enhancer  38.58 
 
 
612 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0218  stage II sporulation protein D  34.78 
 
 
358 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2838  SpoIID/LytB domain protein  38.58 
 
 
616 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3624  SpoIID/LytB domain protein  43.97 
 
 
459 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000549962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  33.02 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2158  stage II sporulation protein D  32.69 
 
 
340 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0059  amidase enhancer  33.83 
 
 
519 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2376  stage II sporulation protein D  32.41 
 
 
291 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2743  SpoIID/LytB domain protein  37.8 
 
 
612 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0056  amidase enhancer  32.43 
 
 
515 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1742  SpoIID/LytB domain protein  29.53 
 
 
1032 aa  57.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.334202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  33.02 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  33.02 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  33.02 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  33.02 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  31.9 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  33.02 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  33.02 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1752  putative amidase enhancer  26.92 
 
 
517 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17760  sporulation stage II protein D  30.16 
 
 
319 aa  56.6  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.377102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3399  stage II sporulation protein D  31.58 
 
 
343 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  33.02 
 
 
339 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  35.42 
 
 
339 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0106  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.23 
 
 
347 aa  56.2  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0197  SpoIID/LytB domain protein  36.7 
 
 
538 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>