More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3474 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3474  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
127 aa  239  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  53.17 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  50.81 
 
 
129 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  48.65 
 
 
126 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  51.26 
 
 
126 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  47.22 
 
 
150 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  52.85 
 
 
128 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  54.87 
 
 
146 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  45.38 
 
 
127 aa  97.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  56.57 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  56.57 
 
 
131 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  45.37 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  49.04 
 
 
127 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  48.33 
 
 
127 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  48.74 
 
 
129 aa  93.6  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  49.04 
 
 
127 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  43.7 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  46.49 
 
 
127 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  45 
 
 
127 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  47.93 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  45.38 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  51.3 
 
 
128 aa  89.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  47.66 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  50.45 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  53.19 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  45 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
127 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
127 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
127 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
127 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
127 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  46.02 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  48.21 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  55.17 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  45.83 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  46.3 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  48.15 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  43.52 
 
 
126 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  46.3 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  49.44 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  50 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  50.94 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  48.31 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  46.6 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  43.36 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  43.36 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  40.16 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  41.59 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  41.59 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  51.14 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  42.22 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  45.83 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  30.17 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  38.89 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  35.23 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  35.9 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>