30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1889 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  828    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0998  hypothetical protein  42.59 
 
 
432 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2174  hypothetical protein  39.89 
 
 
426 aa  156  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00796249  hitchhiker  0.00000589334 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  29.58 
 
 
432 aa  151  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2816  hypothetical protein  36.56 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2753  hypothetical protein  36.56 
 
 
438 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0620  hypothetical protein  36.32 
 
 
438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1707  hypothetical protein  36.32 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2894  hypothetical protein  36.32 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2393  hypothetical protein  36.32 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2696  hypothetical protein  36.08 
 
 
466 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1802  hypothetical protein  37.89 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0701  hypothetical protein  28.53 
 
 
436 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3588  hypothetical protein  33.11 
 
 
427 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4665  putative transmembrane protein  33.11 
 
 
427 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  29.93 
 
 
451 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02303  hypothetical protein  32.85 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1790  hypothetical protein  29.21 
 
 
426 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2114  putative transmembrane protein  28.78 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.868258  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2084  hypothetical protein  31.93 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.506799 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  25.7 
 
 
407 aa  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  24.1 
 
 
428 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5063  hypothetical protein  42.11 
 
 
462 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1977  hypothetical protein  28.84 
 
 
434 aa  53.1  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0435007  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  28.76 
 
 
408 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  21.7 
 
 
410 aa  50.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1160  hypothetical protein  30.3 
 
 
463 aa  48.5  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.300381 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1635  peptidase M50  25.97 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  21.77 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  29.61 
 
 
452 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>