32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1064 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  174  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0748  hypothetical protein  59.76 
 
 
84 aa  98.6  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.81 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  44.07 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.8 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  41.43 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  40.24 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  45 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  45 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  43.64 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.79 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.79 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  42.86 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  35.37 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  44.64 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  38.67 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  50 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  37.7 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  34.38 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  44.64 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  36.07 
 
 
81 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  53.66 
 
 
92 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  41.07 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  41.07 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  44.23 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1510  putative virulence-associated protein  39.71 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239503  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  37.7 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  53.49 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  42.65 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.5 
 
 
78 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  36.78 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  33.33 
 
 
96 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.470298 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>