30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0933 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0933  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  578  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2176  hypothetical protein  89.22 
 
 
306 aa  548  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2404  hypothetical protein  86.56 
 
 
306 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2871  hypothetical protein  80.07 
 
 
306 aa  501  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25120  hypothetical protein  72.83 
 
 
304 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0874  hypothetical protein  48.03 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.801729  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0425  hypothetical protein  48.03 
 
 
330 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0904  hypothetical protein  48.03 
 
 
330 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472436  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4370  hypothetical protein  47.12 
 
 
307 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0962975  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1162  hypothetical protein  48.31 
 
 
304 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1562  hypothetical protein  47.16 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.252328  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6035  hypothetical protein  44.92 
 
 
316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1976  hypothetical protein  42.31 
 
 
307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4769  hypothetical protein  43.31 
 
 
307 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184998  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1199  hypothetical protein  37.05 
 
 
308 aa  193  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000053087  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1964  hypothetical protein  38.72 
 
 
305 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0348  hypothetical protein  41.73 
 
 
304 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.975914  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4611  hypothetical protein  41.34 
 
 
310 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.626183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1991  hypothetical protein  34.95 
 
 
311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1880  hypothetical protein  34.6 
 
 
311 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.118335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0439  hypothetical protein  40.71 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0688498  normal  0.363441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3364  hypothetical protein  36.52 
 
 
315 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.041289  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6591  hypothetical protein  36.52 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0570  hypothetical protein  46.83 
 
 
199 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6340  hypothetical protein  62.3 
 
 
65 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.932896  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1141  hypothetical protein  29.41 
 
 
146 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0196  hypothetical protein  30.38 
 
 
320 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0784  hypothetical protein  60.98 
 
 
84 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11430  protein of unknown function (DUF1814)  25.85 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.442396  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0191  Domain of unknown function DUF1814  29.73 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.233104  hitchhiker  0.00266112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>