40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2257 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2257  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 244 aa  500  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3651  protein tyrosine/serine phosphatase  44.81 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2038  protein tyrosine/serine phosphatase  48.77 
 
 		 241 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2078  hypothetical protein  48.77 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2352  protein tyrosine/serine phosphatase  48.77 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.297898  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2662  protein tyrosine/serine phosphatase  47.78 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.037734  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2901  protein tyrosine/serine phosphatase  45.81 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.352749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4537  protein tyrosine/serine phosphatase  40.55 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0635  hypothetical protein  41.94 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.187995  normal  0.133713 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1518  protein tyrosine/serine phosphatase  37.61 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3253  protein tyrosine/serine phosphatase  39.09 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2105  protein tyrosine/serine phosphatase  37.9 
 
 		 220 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4215  protein tyrosine/serine phosphatase  38.04 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1017  protein tyrosine/serine phosphatase  37.44 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0412  protein tyrosine/serine phosphatase  40 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.270041  hitchhiker  0.00092247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0236  hypothetical protein  40 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0375  tyrosine/serine protein phosphatase  39.01 
 
 		 191 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0043  protein tyrosine/serine phosphatase  39.1 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  29.69 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0085  protein tyrosine/serine phosphatase  30.65 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000064897  hitchhiker  0.000366859 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0208  protein tyrosine/serine phosphatase  28.46 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2841  hypothetical protein  32.08 
 
 		 693 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  35.51 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0552  protein tyrosine/serine phosphatase  28.46 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04426  tyrosine phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G07000)  26.21 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.197924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0048  protein tyrosine/serine phosphatase  26.83 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1223  hypothetical protein  34.58 
 
 		 218 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2473  protein tyrosine/serine phosphatase  27.42 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.668648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3179  protein tyrosine/serine phosphatase  28.21 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0322  protein of unknown function DUF442  29.84 
 
 		 166 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13660  hypothetical protein  33.64 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.615476  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2856  protein of unknown function DUF442  31.71 
 
 		 140 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.778829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3049  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02810  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 		 279 aa  46.2  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3576  hypothetical protein  27.54 
 
 		 193 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3047  hypothetical protein  25.25 
 
 		 127 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03710  protein-tyrosine-phosphatase, putative  37.5 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0986635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2528  Dual specificity protein phosphatase  28.71 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  25.36 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1435  dual specificity protein phosphatase  30.77 
 
 		 156 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.34251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>