34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0531 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0531  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  223  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.681359  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2750  hypothetical protein  51.89 
 
 		 108 aa  116  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5558  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.4 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1487  plasmid stabilization system protein  48.11 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2739  plasmid stabilization system protein  42.73 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1043  plasmid stabilization system  37.25 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0957  hypothetical protein  33.01 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.709884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0677  plasmid stabilization system protein  36.84 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.781878 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  35.92 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1790  putative plasmid stabilization system protein protein  33.65 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  31.07 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0757  hypothetical protein  30.19 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0654  plasmid stabilization system toxin protein  29.25 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  28.16 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  30.1 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0757  hypothetical protein  33.66 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.21 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  31.68 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0480  plasmid stabilization system protein  34.48 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.414402 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  33.94 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02600  hypothetical protein  29.41 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  28.71 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003262  plasmid stabilization system protein  29.41 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0681  hypothetical protein  25.93 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1971  hypothetical protein  35.24 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.866936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1783  plasmid stabilization system protein  29.29 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3157  plasmid stabilization system  33.66 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553331  normal  0.296487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1455  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.421836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  31 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3420  plasmid stabilization system protein  26.09 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.7 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02187  toxin of toxin-antitoxin stability system  34.67 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.3 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>