More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1215 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  67.07 
 
 		 559 aa  703    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1215  methylmalonyl-CoA decarboxylase alpha chain  100 
 
 		 519 aa  1057    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.336846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  73.08 
 
 		 514 aa  776    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  62.1 
 
 		 518 aa  642    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2771  carboxyl transferase  68.11 
 
 		 549 aa  708    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6502  carboxyl transferase  67.15 
 
 		 529 aa  679    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838117  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  61.1 
 
 		 550 aa  627  1e-178  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  60.28 
 
 		 531 aa  621  1e-177  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  57.84 
 
 		 516 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  59.31 
 
 		 516 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  57.58 
 
 		 518 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  58.46 
 
 		 516 aa  607  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  59.07 
 
 		 513 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  57.25 
 
 		 522 aa  604  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  54.03 
 
 		 516 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  57.4 
 
 		 517 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  53.91 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  56.97 
 
 		 522 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  57.68 
 
 		 508 aa  593  1e-168  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  57.09 
 
 		 531 aa  593  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  56.74 
 
 		 522 aa  588  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  55.6 
 
 		 516 aa  590  1e-167  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  59.51 
 
 		 516 aa  590  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  57.49 
 
 		 529 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  56.48 
 
 		 519 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  57.03 
 
 		 530 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  56.31 
 
 		 534 aa  578  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  56.78 
 
 		 516 aa  580  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  59.8 
 
 		 519 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  59.8 
 
 		 519 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  55.36 
 
 		 510 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  59.8 
 
 		 519 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  53.31 
 
 		 514 aa  580  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  54.97 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  55.01 
 
 		 515 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  54.78 
 
 		 510 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  56.03 
 
 		 528 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  57.37 
 
 		 516 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  55.95 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  55.01 
 
 		 515 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  55.53 
 
 		 527 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  53.86 
 
 		 520 aa  574  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  58.59 
 
 		 520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  51.95 
 
 		 516 aa  569  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  54.76 
 
 		 517 aa  571  1e-161  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  56.34 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  57.2 
 
 		 530 aa  571  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  51.56 
 
 		 516 aa  569  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  54.97 
 
 		 523 aa  571  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  54.88 
 
 		 510 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  54.95 
 
 		 517 aa  570  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  53.41 
 
 		 514 aa  570  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  56.26 
 
 		 510 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  56.57 
 
 		 537 aa  568  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  53.89 
 
 		 510 aa  569  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  54.78 
 
 		 510 aa  571  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  53.61 
 
 		 510 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  54.58 
 
 		 510 aa  569  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  54 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  57.26 
 
 		 516 aa  571  1e-161  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  53.09 
 
 		 512 aa  567  1e-160  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  53.09 
 
 		 521 aa  567  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  51.76 
 
 		 516 aa  567  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  56.24 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  53.98 
 
 		 512 aa  567  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  54.62 
 
 		 511 aa  566  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  55.73 
 
 		 519 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  54.53 
 
 		 510 aa  567  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  54.49 
 
 		 517 aa  565  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  55.45 
 
 		 546 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  53.77 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  55.73 
 
 		 510 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  54.12 
 
 		 510 aa  565  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  54.39 
 
 		 510 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  56.03 
 
 		 513 aa  567  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  55.01 
 
 		 520 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  55.94 
 
 		 510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  54.1 
 
 		 510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2342  carboxyl transferase  54.73 
 
 		 510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.150986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  55.53 
 
 		 510 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  55.01 
 
 		 513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  55.65 
 
 		 510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  53.91 
 
 		 510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  54.1 
 
 		 510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  55.35 
 
 		 510 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  50.97 
 
 		 524 aa  560  1e-158  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  54.58 
 
 		 510 aa  560  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  55.51 
 
 		 531 aa  559  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  53.92 
 
 		 510 aa  560  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  54.53 
 
 		 510 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  54.97 
 
 		 527 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  52.5 
 
 		 513 aa  559  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  53.88 
 
 		 540 aa  558  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  54.71 
 
 		 524 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  52.83 
 
 		 510 aa  560  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1317  carboxyl transferase  54.6 
 
 		 510 aa  559  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.182185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  53.91 
 
 		 536 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  50.39 
 
 		 523 aa  558  1e-157  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  54.28 
 
 		 510 aa  556  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  54.28 
 
 		 536 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>