90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0855 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  73.36 
 
 
263 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  65.35 
 
 
260 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  57.59 
 
 
258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  57.87 
 
 
302 aa  297  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  58.37 
 
 
261 aa  294  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  56.98 
 
 
265 aa  289  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  56.06 
 
 
262 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  52.09 
 
 
300 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  53.49 
 
 
319 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  50.98 
 
 
255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  49.6 
 
 
289 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  46.33 
 
 
258 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  52.02 
 
 
264 aa  224  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  48.41 
 
 
287 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  49.03 
 
 
297 aa  222  6e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  47.66 
 
 
296 aa  215  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  47.47 
 
 
259 aa  215  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  47.08 
 
 
255 aa  214  8e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  46.9 
 
 
273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  47.62 
 
 
266 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  47.13 
 
 
326 aa  208  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  46.03 
 
 
301 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  44.23 
 
 
281 aa  202  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  43.28 
 
 
290 aa  203  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  47.24 
 
 
294 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  45.21 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  45.49 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  45.11 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  43.75 
 
 
333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  46.83 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  42.86 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  44 
 
 
283 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  43.48 
 
 
281 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  38.81 
 
 
307 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  41.34 
 
 
254 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  41.96 
 
 
270 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  39.03 
 
 
256 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  39.03 
 
 
256 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.66 
 
 
258 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  37.35 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  38.89 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  35.69 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  30 
 
 
196 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  29.26 
 
 
197 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  29.84 
 
 
196 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  30.37 
 
 
197 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  30.37 
 
 
197 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  30.37 
 
 
211 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  29.84 
 
 
197 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  28.72 
 
 
211 aa  92.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  30.37 
 
 
197 aa  92.4  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  32.07 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  35.65 
 
 
143 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  30.98 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  30.98 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  29 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  28.73 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.84 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.72 
 
 
218 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  28.28 
 
 
232 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  28.92 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0069  GDSL family lipase  28.04 
 
 
244 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.074749  normal  0.034265 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  29.51 
 
 
305 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  32.24 
 
 
368 aa  48.9  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  37.23 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0068  lipolytic protein  30.73 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0074  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  33.9 
 
 
275 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  33.9 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 
216 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0086  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 
240 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0717597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3955  GDSL family lipase  27.37 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00727916  normal  0.035201 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  28.81 
 
 
189 aa  46.2  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  28.3 
 
 
329 aa  45.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000200149 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  33.33 
 
 
223 aa  45.4  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  23.22 
 
 
225 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2582  lipolytic protein G-D-S-L family  26.61 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  25.12 
 
 
265 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  33.05 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1812  lipolytic protein G-D-S-L family  21.7 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000302668  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  26.23 
 
 
200 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3922  GDSL family lipase  28.24 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  23.76 
 
 
216 aa  42.7  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5194  GDSL family lipase  26.15 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  29.13 
 
 
222 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0853  GDSL family lipase  30.13 
 
 
361 aa  42.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  22.87 
 
 
266 aa  42.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1047  lipolytic protein G-D-S-L family  29 
 
 
343 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0910  GDSL family lipase  30.82 
 
 
361 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.526687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>