42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_R0067 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_R0067  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0050  tRNA-Leu  91.76 
 
 
83 bp  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0070  tRNA-Leu  90.77 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142723  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0074  tRNA-Leu  90.77 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000023542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0055  tRNA-Leu  87.34 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000135944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0040  tRNA-Leu  87.34 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0035  tRNA-Leu  95.56 
 
 
88 bp  73.8  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000252903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0055  tRNA-Leu  89.71 
 
 
84 bp  71.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000273568  normal  0.583061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0029  tRNA-Leu  91.04 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0067  tRNA-Leu  97.44 
 
 
83 bp  69.9  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00988664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0018  tRNA-Leu  91.3 
 
 
83 bp  60  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.125482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0056  tRNA-Leu  92.31 
 
 
85 bp  54  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0026  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  54  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000394336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0055  tRNA-Leu  90.48 
 
 
85 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000760879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0045  tRNA-Leu  93.94 
 
 
88 bp  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0092775  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0066  tRNA-Leu  90.24 
 
 
85 bp  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0051  tRNA-Leu  96.55 
 
 
83 bp  50.1  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  91.67 
 
 
87 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0047  tRNA-Leu  88.64 
 
 
85 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.343405  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0058  tRNA-Leu  88.37 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03410  tRNA-Leu  88.37 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.706698 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26300  tRNA-Leu  88.37 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0108  tRNA-Leu  96.3 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000140726  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0261  tRNA-Leu  96.3 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000661885  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1465  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0025  tRNA-Leu  91.43 
 
 
84 bp  46.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.333902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0009  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0043  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0017  tRNA-Leu  100 
 
 
89 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000414228  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  100 
 
 
84 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0014  tRNA-Leu  93.33 
 
 
85 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 
86 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0005  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202243  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0055  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0003  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.130839  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>