158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2241 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2241  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  229  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2739  2Fe-2S ferredoxin  49.5 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  44.21 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  48.35 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  48.35 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  35.29 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  34.31 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  34.31 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  33 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  30.69 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  30.69 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4743  hypothetical protein  31.58 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  32.04 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  31.07 
 
 		 614 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  33 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  34.74 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 		 596 aa  58.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.61 
 
 		 410 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  36.08 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  31.19 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  32.32 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  38.37 
 
 		 635 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  32 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.87 
 
 		 677 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  31.91 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  32 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  28.74 
 
 		 572 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  35.37 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  31.82 
 
 		 597 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  34.07 
 
 		 626 aa  55.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.46 
 
 		 408 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3087  ferredoxin-like protein  30.48 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  31.25 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  29.13 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  30.39 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  33.33 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.43 
 
 		 410 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  30.21 
 
 		 626 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  30.21 
 
 		 626 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 		 569 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  32.26 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5226  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  25.29 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268392 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  31.58 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  29.89 
 
 		 595 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1539  hypothetical protein  30.53 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  27.17 
 
 		 614 aa  50.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  26.88 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  36.67 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  26.51 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5363  Ferredoxin-like protein  32.65 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.939561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4280  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.135109  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  28.28 
 
 		 343 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  25 
 
 		 572 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  28.72 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  38.46 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4529  hypothetical protein  24.44 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  37.93 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2160  NADH dehydrogenase (quinone)  29.49 
 
 		 562 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  25.23 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  30.53 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  37.68 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01520  nitrogen fixation (2Fe-2S) ferredoxin (Shethna I protein) , FeS1  28.87 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  30.23 
 
 		 594 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  29.59 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  29.89 
 
 		 596 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1111  hypothetical protein  32.1 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  27.78 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2304  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  29.81 
 
 		 623 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3657  hypothetical protein  28.05 
 
 		 182 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0379368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  25 
 
 		 596 aa  47.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  25.77 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2452  iron-sulfur cluster-binding protein like protein  28.05 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  26.53 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  35.21 
 
 		 619 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  28.42 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  26.26 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  24.24 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  29.63 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  26.8 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  33.8 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  33.93 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  32.39 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  28.21 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  26.14 
 
 		 597 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  23.26 
 
 		 610 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0532  NADH dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 		 620 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0280377  normal  0.055647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  28.28 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  28.28 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24670  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  30.43 
 
 		 597 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  23.23 
 
 		 607 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  27.06 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  31.48 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  31.48 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  23.23 
 
 		 607 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  30 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  31.25 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  32.14 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0596  ferredoxin, 2Fe-2S  32.29 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.806295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>