28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4477 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4477  RDD domain containing protein  100 
 
 		 174 aa  332  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  43.62 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3132  hypothetical protein  40.52 
 
 		 347 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  34.3 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  34.21 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  29.17 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4478  RDD domain containing protein  27.81 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0451  RDD domain-containing protein  31.25 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  30.43 
 
 		 447 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  34.27 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  31.85 
 
 		 194 aa  48.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  30.71 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  28.67 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  29.38 
 
 		 276 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  29.11 
 
 		 393 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4251  RDD domain-containing protein  32.41 
 
 		 313 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  26.14 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  26.38 
 
 		 257 aa  44.7  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  29.79 
 
 		 137 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  30.5 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49805  predicted protein  30.26 
 
 		 389 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193845  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 327 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07960  predicted membrane protein/domain  27.72 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.140076  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  35.85 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  34.67 
 
 		 340 aa  41.2  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2700  RDD domain containing protein  38.75 
 
 		 537 aa  41.2  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  28.28 
 
 		 270 aa  40.8  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>