115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4057 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4057  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 111 aa  208  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1391  putative transcriptional regulator, MerR family  75.23 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.345366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0762  MerR family transcriptional regulator  71.3 
 
 		 110 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.111351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3756  putative transcriptional regulator, MerR family  63.96 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4611  transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  56.52 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  60 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  52.17 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  54.35 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 336 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 283 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  46.81 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  52.08 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3082  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.1323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  52.17 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.78 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3844  transcriptional regulator, MerR family  28.26 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.603426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 133 aa  42.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  50 
 
 		 336 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  42.55 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 333 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 122 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 137 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 139 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  47.73 
 
 		 339 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  52.5 
 
 		 112 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 122 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  37.25 
 
 		 139 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  52.63 
 
 		 123 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2778  transcriptional regulator, MerR family  44.23 
 
 		 305 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.779446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  47.73 
 
 		 354 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5793  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  43.18 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 249 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  46.94 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  37.23 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  40.82 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  36.73 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  44.9 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  46.81 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  52.63 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  42.22 
 
 		 134 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  43.9 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>