51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4041 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4041  hypothetical protein  100 
 
 		 596 aa  1189    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.140814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2494  lipoprotein LpqB  34.78 
 
 		 626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0457772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3743  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain protein  30.79 
 
 		 624 aa  223  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1414  hypothetical protein  31.03 
 
 		 587 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0312694  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0772  hypothetical protein  29.95 
 
 		 602 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.741003  normal  0.356549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1435  hypothetical protein  31.61 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46081  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1763  hypothetical protein  30.59 
 
 		 575 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.527347  normal  0.989426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4283  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  29.29 
 
 		 575 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2710  lipoprotein LpqB  28.3 
 
 		 573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.168235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1825  hypothetical protein  28.69 
 
 		 583 aa  144  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1242  lipoprotein LpqB  30.36 
 
 		 586 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.961834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2441  lipoprotein LpqB  27.72 
 
 		 571 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000179765 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2330  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  29.98 
 
 		 556 aa  126  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0424671  decreased coverage  0.00000109415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30920  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  27.15 
 
 		 586 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08610  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  28.25 
 
 		 593 aa  121  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.377465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3813  hypothetical protein  27.78 
 
 		 588 aa  114  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.801802  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09360  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  29.39 
 
 		 590 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20630  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  26.68 
 
 		 568 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.373808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4247  hypothetical protein  28.69 
 
 		 614 aa  107  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0196492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13273  lipoprotein LpqB  30.45 
 
 		 583 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.128269  normal  0.58651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4710  lipoprotein LpqB  28.28 
 
 		 586 aa  93.6  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2512  hypothetical protein  28.24 
 
 		 573 aa  92  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6308  hypothetical protein  24.76 
 
 		 577 aa  90.5  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.890193  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0044  hypothetical protein  25.4 
 
 		 576 aa  85.1  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.976298  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1754  lipoprotein LpqB  27.09 
 
 		 585 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1383  lipoprotein LpqB  26.57 
 
 		 587 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723568 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1367  lipoprotein LpqB  26.57 
 
 		 587 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1349  lipoprotein LpqB  26.57 
 
 		 587 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255019  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1078  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  27.09 
 
 		 594 aa  77.4  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3635  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  26.97 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1851  hypothetical protein  28.12 
 
 		 587 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0906  hypothetical protein  25.38 
 
 		 589 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  31.93 
 
 		 543 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  31.9 
 
 		 195 aa  52.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0969  hypothetical protein  25.6 
 
 		 589 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0969426  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  31.09 
 
 		 349 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  28.03 
 
 		 484 aa  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  34.27 
 
 		 328 aa  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  31.09 
 
 		 349 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  31.09 
 
 		 349 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  31.09 
 
 		 349 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  30.25 
 
 		 349 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  31.09 
 
 		 349 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  30.09 
 
 		 349 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  30.25 
 
 		 349 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2601  germination (cortex hydrolysis) and sporulation (stage II, multiple polar septa)  33.6 
 
 		 358 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0849  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  31.2 
 
 		 357 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  30.09 
 
 		 349 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  29.2 
 
 		 349 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  31.09 
 
 		 545 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  33.06 
 
 		 192 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>