34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3635 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3635  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  100 
 
 		 584 aa  1143    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1383  lipoprotein LpqB  39.46 
 
 		 587 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1349  lipoprotein LpqB  39.29 
 
 		 587 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1367  lipoprotein LpqB  39.29 
 
 		 587 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4710  lipoprotein LpqB  38.47 
 
 		 586 aa  339  7e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1754  lipoprotein LpqB  38.23 
 
 		 585 aa  336  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13273  lipoprotein LpqB  36.88 
 
 		 583 aa  333  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.128269  normal  0.58651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1078  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  35.02 
 
 		 594 aa  306  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30920  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  30.62 
 
 		 586 aa  191  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6308  hypothetical protein  28.49 
 
 		 577 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.890193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4247  hypothetical protein  30.6 
 
 		 614 aa  146  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0196492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4283  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  30.16 
 
 		 575 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2494  lipoprotein LpqB  30.48 
 
 		 626 aa  106  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0457772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0772  hypothetical protein  28.39 
 
 		 602 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.741003  normal  0.356549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2441  lipoprotein LpqB  26.71 
 
 		 571 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000179765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3813  hypothetical protein  30.18 
 
 		 588 aa  83.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.801802  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2710  lipoprotein LpqB  25.49 
 
 		 573 aa  82.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.168235  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1435  hypothetical protein  26.81 
 
 		 582 aa  82  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46081  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1825  hypothetical protein  27.21 
 
 		 583 aa  80.5  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1851  hypothetical protein  23.36 
 
 		 587 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3743  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain protein  28.7 
 
 		 624 aa  78.2  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1414  hypothetical protein  26.05 
 
 		 587 aa  76.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0312694  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08610  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  27.39 
 
 		 593 aa  73.9  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.377465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20630  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  28.5 
 
 		 568 aa  72  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.373808  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0044  hypothetical protein  23.84 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.976298  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2330  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  30.53 
 
 		 556 aa  70.1  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0424671  decreased coverage  0.00000109415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1242  lipoprotein LpqB  26.08 
 
 		 586 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.961834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4041  hypothetical protein  27.04 
 
 		 596 aa  64.3  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.140814  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2512  hypothetical protein  29.96 
 
 		 573 aa  62  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0969  hypothetical protein  24.08 
 
 		 589 aa  54.3  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0969426  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0906  hypothetical protein  24.32 
 
 		 589 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09360  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  30 
 
 		 590 aa  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1763  hypothetical protein  25.35 
 
 		 575 aa  47.8  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.527347  normal  0.989426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.87 
 
 		 395 aa  45.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>