33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2512 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2512  hypothetical protein  100 
 
 
573 aa  1102    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09360  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  35.25 
 
 
590 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57766  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1825  hypothetical protein  33.67 
 
 
583 aa  236  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1242  lipoprotein LpqB  34.54 
 
 
586 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.961834  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2330  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  33.76 
 
 
556 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0424671  decreased coverage  0.00000109415 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08610  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  30.43 
 
 
593 aa  163  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.377465  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20630  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  29.02 
 
 
568 aa  160  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.373808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2710  lipoprotein LpqB  27.68 
 
 
573 aa  150  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.168235  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2441  lipoprotein LpqB  27.14 
 
 
571 aa  150  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000179765 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0044  hypothetical protein  25.65 
 
 
576 aa  139  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.976298  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3813  hypothetical protein  32.59 
 
 
588 aa  110  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.801802  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0772  hypothetical protein  28.32 
 
 
602 aa  107  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.741003  normal  0.356549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1435  hypothetical protein  26.94 
 
 
582 aa  99.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4041  hypothetical protein  28.36 
 
 
596 aa  93.6  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.140814  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30920  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  29.63 
 
 
586 aa  91.3  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2494  lipoprotein LpqB  25.29 
 
 
626 aa  90.5  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0457772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6308  hypothetical protein  32.24 
 
 
577 aa  87.4  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.890193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4283  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  27.69 
 
 
575 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4247  hypothetical protein  31.39 
 
 
614 aa  77  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0196492  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4710  lipoprotein LpqB  29.71 
 
 
586 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1349  lipoprotein LpqB  28.88 
 
 
587 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1383  lipoprotein LpqB  28.88 
 
 
587 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.723568 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1367  lipoprotein LpqB  28.88 
 
 
587 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13273  lipoprotein LpqB  28.07 
 
 
583 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.128269  normal  0.58651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3635  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  29.96 
 
 
584 aa  70.5  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1414  hypothetical protein  26.72 
 
 
587 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0312694  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1754  lipoprotein LpqB  29.67 
 
 
585 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1078  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  30.61 
 
 
594 aa  70.1  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1851  hypothetical protein  25.38 
 
 
587 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3743  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain protein  27.87 
 
 
624 aa  60.8  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0906  hypothetical protein  24.49 
 
 
589 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1763  hypothetical protein  29.44 
 
 
575 aa  47.4  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.527347  normal  0.989426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0969  hypothetical protein  24.93 
 
 
589 aa  45.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0969426  normal  0.97035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>