31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0772 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0772  hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1197    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.741003  normal  0.356549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1414  hypothetical protein  36.9 
 
 
587 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0312694  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2494  lipoprotein LpqB  28.55 
 
 
626 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0457772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4041  hypothetical protein  29.82 
 
 
596 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.140814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3743  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain protein  27.53 
 
 
624 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1435  hypothetical protein  30.56 
 
 
582 aa  143  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46081  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4283  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  28.45 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1825  hypothetical protein  29.9 
 
 
583 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1242  lipoprotein LpqB  30 
 
 
586 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.961834  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6308  hypothetical protein  25.52 
 
 
577 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.890193  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30920  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  25.93 
 
 
586 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1763  hypothetical protein  25.97 
 
 
575 aa  107  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.527347  normal  0.989426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2330  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  26.6 
 
 
556 aa  104  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0424671  decreased coverage  0.00000109415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3635  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  28.3 
 
 
584 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09360  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  26.63 
 
 
590 aa  99.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57766  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2512  hypothetical protein  28.43 
 
 
573 aa  98.6  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08610  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  25.45 
 
 
593 aa  97.8  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.377465  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4247  hypothetical protein  27.37 
 
 
614 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0196492  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2441  lipoprotein LpqB  26.22 
 
 
571 aa  90.9  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000179765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1754  lipoprotein LpqB  26 
 
 
585 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3813  hypothetical protein  27.71 
 
 
588 aa  90.1  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.801802  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1383  lipoprotein LpqB  27.46 
 
 
587 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.723568 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1367  lipoprotein LpqB  27.67 
 
 
587 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1349  lipoprotein LpqB  27.67 
 
 
587 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4710  lipoprotein LpqB  25.89 
 
 
586 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1851  hypothetical protein  28.66 
 
 
587 aa  86.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1078  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  27.74 
 
 
594 aa  84.3  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13273  lipoprotein LpqB  26.75 
 
 
583 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.128269  normal  0.58651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20630  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  24.26 
 
 
568 aa  73.9  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.373808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2710  lipoprotein LpqB  25.27 
 
 
573 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.168235  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0044  hypothetical protein  23.36 
 
 
576 aa  71.6  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.976298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>