29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0044 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0044  hypothetical protein  100 
 
 
576 aa  1169    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.976298  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2512  hypothetical protein  26 
 
 
573 aa  131  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08610  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  25.99 
 
 
593 aa  121  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.377465  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1825  hypothetical protein  30.27 
 
 
583 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1242  lipoprotein LpqB  29.22 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.961834  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09360  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  24.9 
 
 
590 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57766  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2441  lipoprotein LpqB  26.93 
 
 
571 aa  107  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000179765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2710  lipoprotein LpqB  25.28 
 
 
573 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.168235  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20630  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  23.47 
 
 
568 aa  98.2  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.373808  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2330  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  31.06 
 
 
556 aa  97.1  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0424671  decreased coverage  0.00000109415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3813  hypothetical protein  28.38 
 
 
588 aa  84  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.801802  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4041  hypothetical protein  25.62 
 
 
596 aa  84  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.140814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1414  hypothetical protein  30.96 
 
 
587 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0312694  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1435  hypothetical protein  22.39 
 
 
582 aa  77  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4247  hypothetical protein  25.29 
 
 
614 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0196492  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4710  lipoprotein LpqB  26.32 
 
 
586 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1754  lipoprotein LpqB  26.42 
 
 
585 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0772  hypothetical protein  23.36 
 
 
602 aa  71.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.741003  normal  0.356549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3635  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  23.84 
 
 
584 aa  70.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13273  lipoprotein LpqB  26.51 
 
 
583 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.128269  normal  0.58651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1078  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  25.93 
 
 
594 aa  66.6  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1383  lipoprotein LpqB  22.98 
 
 
587 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.723568 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1367  lipoprotein LpqB  25.37 
 
 
587 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1349  lipoprotein LpqB  25.37 
 
 
587 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30920  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  24.19 
 
 
586 aa  62.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2494  lipoprotein LpqB  23.9 
 
 
626 aa  61.6  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0457772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3743  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain protein  24.91 
 
 
624 aa  61.6  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6308  hypothetical protein  26.95 
 
 
577 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.890193  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1763  hypothetical protein  27.91 
 
 
575 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.527347  normal  0.989426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>