26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0906 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0969  hypothetical protein  77.16 
 
 		 589 aa  881    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0969426  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0906  hypothetical protein  100 
 
 		 589 aa  1170    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1851  hypothetical protein  25.56 
 
 		 587 aa  94.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1825  hypothetical protein  25.49 
 
 		 583 aa  79  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30920  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  26.01 
 
 		 586 aa  75.1  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4283  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  28.87 
 
 		 575 aa  68.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1435  hypothetical protein  25.43 
 
 		 582 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4247  hypothetical protein  24.43 
 
 		 614 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0196492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20630  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  25.62 
 
 		 568 aa  62.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.373808  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2494  lipoprotein LpqB  28.34 
 
 		 626 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0457772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4710  lipoprotein LpqB  25.08 
 
 		 586 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2330  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  25.63 
 
 		 556 aa  53.5  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0424671  decreased coverage  0.00000109415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6308  hypothetical protein  24.85 
 
 		 577 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.890193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3635  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  24.27 
 
 		 584 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.926396  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1078  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain-like protein  23.84 
 
 		 594 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1242  lipoprotein LpqB  31.33 
 
 		 586 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.961834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4041  hypothetical protein  25.1 
 
 		 596 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.140814  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09360  lipoprotein LpqB family protein/sporulation and spore germination protein  24.61 
 
 		 590 aa  51.2  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1414  hypothetical protein  26.1 
 
 		 587 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0312694  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1383  lipoprotein LpqB  23.77 
 
 		 587 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1754  lipoprotein LpqB  28.99 
 
 		 585 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3743  Lipoprotein LpqB, beta-propeller domain protein  28.68 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1367  lipoprotein LpqB  23.58 
 
 		 587 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1349  lipoprotein LpqB  23.58 
 
 		 587 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3813  hypothetical protein  30.22 
 
 		 588 aa  45.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.801802  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2512  hypothetical protein  24.49 
 
 		 573 aa  44.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>