39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3353 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  100 
 
 		 106 aa  221  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  58.33 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  53.19 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  43.3 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.38 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.04 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.04 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  32.98 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  34.65 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.29 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.29 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.28 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  35.63 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.94 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0681  stress responsive alpha-beta barrel  24.47 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0110519 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.72 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0179  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.12 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0398383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  32.32 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0590  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.65 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1959  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.9 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  25.25 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.59 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  31.58 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30.26 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.73 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0759  hypothetical protein  32.63 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.27 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4769  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.4 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0844  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  23 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000441195  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27.84 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  32.5 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2493  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.3 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27.19 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0455  fructose-bisphosphate aldolase  29.79 
 
 		 412 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0616426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  28.42 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.33 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>