More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1346 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 
299 aa  617  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  67.22 
 
 
306 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  66.56 
 
 
306 aa  434  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  68.58 
 
 
299 aa  434  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  67.89 
 
 
301 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  54.67 
 
 
308 aa  343  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  56.23 
 
 
301 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  56.71 
 
 
301 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  54.52 
 
 
311 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  54.18 
 
 
311 aa  335  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  55.22 
 
 
302 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  52.98 
 
 
316 aa  335  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  54.73 
 
 
297 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  55.33 
 
 
301 aa  334  9e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  54.88 
 
 
299 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  54.18 
 
 
301 aa  332  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  52.36 
 
 
297 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  54.21 
 
 
298 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  51.83 
 
 
299 aa  314  9e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  46.62 
 
 
298 aa  300  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.33 
 
 
305 aa  296  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  46 
 
 
302 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  47.65 
 
 
296 aa  291  7e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  46.33 
 
 
302 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  45.67 
 
 
302 aa  285  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  45.67 
 
 
302 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  43.29 
 
 
298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  43.29 
 
 
298 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  43.29 
 
 
298 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  44.04 
 
 
302 aa  249  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  43.67 
 
 
298 aa  248  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  43.05 
 
 
302 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.18 
 
 
659 aa  92.8  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  32.43 
 
 
475 aa  90.5  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  32.24 
 
 
500 aa  90.5  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
465 aa  89  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
468 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  28.74 
 
 
488 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  29.57 
 
 
488 aa  85.9  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
487 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  34.07 
 
 
488 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  30.18 
 
 
474 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.95 
 
 
646 aa  84  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 
611 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  31.87 
 
 
463 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0772  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  38.33 
 
 
608 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.900207  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0672  amidophosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
475 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.53 
 
 
610 aa  82  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  31.15 
 
 
462 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
472 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  30.39 
 
 
487 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2095  amidophosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
480 aa  81.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.778059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  29.32 
 
 
482 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1419  amidophosphoribosyltransferase  28.73 
 
 
461 aa  80.9  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0127132  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  23.42 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1536  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.33 
 
 
610 aa  80.5  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  36 
 
 
610 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  31.07 
 
 
478 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
497 aa  80.1  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4097  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  40.71 
 
 
609 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2941 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  27.94 
 
 
479 aa  79.7  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  31.49 
 
 
478 aa  79.7  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1357  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  31.45 
 
 
591 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  40.71 
 
 
609 aa  79.3  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5165  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  40.71 
 
 
609 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212663 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03613  D-fructose-6-phosphate amidotransferase  40.71 
 
 
609 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4238  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  40.71 
 
 
609 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03557  hypothetical protein  40.71 
 
 
609 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1160  amidophosphoribosyltransferase  34.18 
 
 
503 aa  79.3  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2658  amidophosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
490 aa  79.3  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3944  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  40.71 
 
 
609 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4244  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  40.71 
 
 
609 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.517855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  30.91 
 
 
469 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4265  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  40.71 
 
 
609 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3498  amidophosphoribosyltransferase  29.89 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349457  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  30.19 
 
 
480 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3881  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  37.5 
 
 
610 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  25.35 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  29.34 
 
 
478 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  30.54 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  24.72 
 
 
371 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  33.14 
 
 
466 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001643  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  35.43 
 
 
610 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0244363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
474 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  32.78 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  32.94 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  29.02 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  29.02 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  29.02 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  29.02 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1152  amidophosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
494 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1130  amidophosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
494 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  29.02 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  29.02 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4086  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  39.82 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4250  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  39.82 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4192  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  39.82 
 
 
609 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.79 
 
 
611 aa  77  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  28.72 
 
 
465 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>