94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0864 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  100 
 
 
630 aa  1300    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  48.88 
 
 
625 aa  523  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  43.31 
 
 
607 aa  496  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  44.26 
 
 
583 aa  473  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1083  hypothetical protein  40.04 
 
 
623 aa  286  7e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.638894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  35.69 
 
 
648 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  37.74 
 
 
653 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  36.79 
 
 
653 aa  277  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  36.79 
 
 
653 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  36.79 
 
 
653 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  36.58 
 
 
653 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  36.58 
 
 
653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  36.58 
 
 
653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  36.58 
 
 
653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  37.21 
 
 
654 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  36.79 
 
 
650 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  37 
 
 
678 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  37 
 
 
678 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  37 
 
 
654 aa  271  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  36.38 
 
 
651 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  36.36 
 
 
653 aa  269  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  36.52 
 
 
650 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  32.41 
 
 
630 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  36.17 
 
 
652 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  35.71 
 
 
662 aa  264  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  34.93 
 
 
631 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  36.77 
 
 
678 aa  244  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  35.5 
 
 
688 aa  243  9e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  36.42 
 
 
651 aa  239  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  35.71 
 
 
650 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  34.86 
 
 
673 aa  217  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  33.05 
 
 
631 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  31.31 
 
 
624 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  30.4 
 
 
612 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  27.72 
 
 
626 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  29.28 
 
 
887 aa  74.3  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  25.54 
 
 
884 aa  70.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  28.69 
 
 
883 aa  70.5  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  24.5 
 
 
699 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  24.94 
 
 
699 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  29.48 
 
 
383 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  24.5 
 
 
699 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  35.05 
 
 
476 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  27.32 
 
 
593 aa  53.9  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3570  hypothetical protein  29.37 
 
 
383 aa  53.9  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  23.88 
 
 
715 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4941  protein of unknown function DUF839  31.09 
 
 
751 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  26.78 
 
 
593 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  33.68 
 
 
386 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  24.19 
 
 
593 aa  52  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  24.15 
 
 
696 aa  51.6  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  29.46 
 
 
444 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  24.14 
 
 
695 aa  51.2  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  26.37 
 
 
786 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1883  hypothetical protein  28.57 
 
 
702 aa  50.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.438445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  23.46 
 
 
677 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  24.78 
 
 
704 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3417  protein of unknown function DUF839  25.11 
 
 
628 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556034  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3290  protein of unknown function DUF839  23.06 
 
 
640 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.922956  normal  0.321253 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3097  hypothetical protein  24.66 
 
 
628 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5569  hypothetical protein  27.27 
 
 
386 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261658  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3105  hypothetical protein  31.4 
 
 
642 aa  48.9  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.44191  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0861  hypothetical protein  21.97 
 
 
690 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0322197 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  23.4 
 
 
458 aa  48.5  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1515  hypothetical protein  28.77 
 
 
471 aa  47.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.594919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0678  protein of unknown function DUF839  23.68 
 
 
693 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0533162  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1501  hypothetical protein  26.81 
 
 
440 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368226  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  28.19 
 
 
739 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2162  protein of unknown function DUF839  26.77 
 
 
389 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  24.54 
 
 
662 aa  46.6  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2674  protein of unknown function DUF839  28.16 
 
 
716 aa  47  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.136187  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4119  protein of unknown function DUF839  28.11 
 
 
708 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.602568  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  25.95 
 
 
587 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3051  putative phosphatase  28.25 
 
 
659 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  28.49 
 
 
667 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2633  hypothetical protein  29.38 
 
 
663 aa  46.2  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.541244  normal  0.427189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0494  WD40 domain-containing protein  43.48 
 
 
386 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4449  hypothetical protein  29.01 
 
 
663 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3949  hypothetical protein  38.18 
 
 
383 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3526  hypothetical protein  26.78 
 
 
630 aa  45.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4291  hypothetical protein  41.3 
 
 
372 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685234  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  27.42 
 
 
672 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  21.17 
 
 
698 aa  44.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3179  protein of unknown function DUF839  32.16 
 
 
818 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3778  hypothetical protein  28.49 
 
 
659 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.913258 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  28.85 
 
 
560 aa  44.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  27.42 
 
 
672 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2746  hypothetical protein  41.3 
 
 
377 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011283  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6044  hypothetical protein  24.44 
 
 
691 aa  44.3  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173775  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  30.09 
 
 
681 aa  44.3  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  23.94 
 
 
596 aa  44.3  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  25 
 
 
694 aa  44.3  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  26.63 
 
 
624 aa  43.9  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4794  protein of unknown function DUF839  23.36 
 
 
690 aa  43.9  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>