141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3337 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8976  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  57.66 
 
 
146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0315  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  48.12 
 
 
147 aa  127  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 
176 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5413  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4415  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.94 
 
 
175 aa  91.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00721125  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0177  hypothetical protein  36.64 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.160815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3675  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.709341  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0159  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.64 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1875  anti-sigma regulatory factor  32.77 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1323  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105677  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 
144 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  36.79 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
286 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1514  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0502369  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  26.92 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
1370 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2515  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.45 
 
 
148 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538602  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  26.15 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  30.56 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  25.38 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  25.38 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1662  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.503488  normal  0.167313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  34.58 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5361  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 
265 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  27.36 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  29.92 
 
 
537 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  25.38 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  25.38 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
1361 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.97 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  31.34 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1225  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00856956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  24.62 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  24.62 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1493  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  24.62 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  26.23 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  27.07 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  24.62 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
1385 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  27.08 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
321 aa  47.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2974  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
151 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33 
 
 
147 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1685  anti-sigma B factor  26.81 
 
 
142 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  29.27 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.94 
 
 
147 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  27.34 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  28.68 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0611  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  30.33 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  32.77 
 
 
603 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  29.27 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12220  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  29.37 
 
 
310 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3290  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018648  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0156  putative signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.888783  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0214018  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  30.69 
 
 
281 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  33.08 
 
 
828 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4484  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  28.68 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1094  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000660088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  35.88 
 
 
618 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 
1390 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 
1390 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 
1390 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129671  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6671  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 
357 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.314942  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3107  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111934  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  32.08 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  26.89 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  30.7 
 
 
234 aa  43.9  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  27.35 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0915  anti-sigma-factor antagonist  29.32 
 
 
243 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2901  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00340315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3289  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.51 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615968  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1839  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.481374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  30.37 
 
 
632 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>