More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2611 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2611  urease subunit gamma  100 
 
 		 200 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.158041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2768  bifunctional urease subunit gamma/beta  77.42 
 
 		 190 aa  268  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1961  bifunctional urease subunit gamma/beta  51.78 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1356  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.17 
 
 		 231 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1135  bifunctional urease subunit gamma/beta  54.17 
 
 		 231 aa  191  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.380732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6190  bifunctional urease subunit gamma/beta  55.21 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0272769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1196  bifunctional urease subunit gamma/beta  53.65 
 
 		 231 aa  190  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.113473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2411  urease, beta/gamma subunit  51.83 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2198  bifunctional urease subunit gamma/beta  52.36 
 
 		 231 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2863  urease, gamma subunit  51.87 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.428533  normal  0.126627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3208  urease, gamma subunit  51.87 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0398  urease, gamma subunit  51.87 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3019  urease, gamma subunit  51.87 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0792777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3244  urease, gamma subunit  51.87 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.502966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4155  urease, gamma subunit  49.2 
 
 		 206 aa  171  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.877974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0888  bifunctional urease subunit gamma/beta  48.94 
 
 		 215 aa  168  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2213  urease, gamma subunit  50.8 
 
 		 206 aa  167  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0025871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3307  urease, gamma subunit  50.8 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0704884  normal  0.481457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1260  bifunctional urease subunit gamma/beta  41.01 
 
 		 248 aa  155  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4048  bifunctional urease subunit gamma/beta  43.58 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0976  bifunctional urease subunit gamma/beta  42.99 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.745602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0056  urease, beta subunit  48.17 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3503  urease, gamma subunit  45.6 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01900  urease  40.19 
 
 		 833 aa  142  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1686  bifunctional urease subunit gamma/beta  47.98 
 
 		 234 aa  141  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.641705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6167  urease, beta subunit  45.88 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.018331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4443  bifunctional urease subunit gamma/beta  42.41 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.836203 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29702  predicted protein  35.29 
 
 		 878 aa  133  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10079  urease, urea amidohydrolase alpha subunit (Eurofung)  37.61 
 
 		 836 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.28583 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30221  urease  37 
 
 		 840 aa  122  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2454  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 100 aa  117  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2307  urease, gamma subunit  59.6 
 
 		 100 aa  117  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0725  urease, gamma subunit  53.54 
 
 		 100 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3692  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2258  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1553  urease subunit gamma  51.04 
 
 		 234 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2488  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1239  urease, gamma subunit  58.59 
 
 		 100 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1498  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.791581  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0872  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1769  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0930  urease subunit gamma  56.57 
 
 		 100 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4008  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.721691  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0792  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0669  urease  58.59 
 
 		 100 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0423  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0781  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0689  urease, gamma subunit  57.58 
 
 		 100 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0902  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3110  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2182  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.901072  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3133  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2055  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3074  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2559  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0725  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2773  urease, gamma subunit  56.57 
 
 		 101 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0880  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  112  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1818  urease, gamma subunit  52.53 
 
 		 100 aa  111  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1729  urease, gamma subunit  54.55 
 
 		 100 aa  111  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0977  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0241  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  111  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3202  urease, gamma subunit  58.59 
 
 		 100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000107337  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2312  urease subunit gamma  50.51 
 
 		 100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.79134  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1077  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2355  urease subunit gamma  50.51 
 
 		 100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1131  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0390  urease subunit gamma  52.53 
 
 		 100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4240  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4224  urease, gamma subunit  55.56 
 
 		 100 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0781796  normal  0.360909 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1869  urease subunit gamma  49.49 
 
 		 100 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3526  urease, gamma subunit  54.55 
 
 		 100 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.37751  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3084  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5693  urease subunit gamma  60.82 
 
 		 114 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0992  urease subunit gamma  55.56 
 
 		 100 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3354  urease subunit gamma  57.58 
 
 		 100 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.664375  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1352  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3399  urease subunit gamma  51.52 
 
 		 100 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1185  urease, gamma subunit  53.54 
 
 		 100 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0834  bifunctional urease subunit gamma/beta  50.27 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4411  urease, gamma subunit  53.54 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1079  urease, gamma subunit  53.54 
 
 		 100 aa  107  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2757  urease, gamma subunit  55.56 
 
 		 100 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0528404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6439  urease subunit gamma  56 
 
 		 100 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691822  normal  0.288199 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2035  urease subunit gamma  52.53 
 
 		 100 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.16208  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_004310  BR1356  urease subunit gamma  50.51 
 
 		 100 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.291374  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2443  urease, gamma subunit  53.54 
 
 		 100 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.972396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0834  urease subunit gamma  58.76 
 
 		 122 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0958  urease subunit gamma  54.55 
 
 		 100 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.0675214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09900  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.587773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4837  urease subunit gamma  51.52 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164995  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1196  urease, gamma subunit  50.51 
 
 		 100 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5586  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.240856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64350  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1557  urease, gamma subunit  45.61 
 
 		 125 aa  104  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2187  urease subunit gamma  50.51 
 
 		 100 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1864  urease subunit gamma  50.51 
 
 		 100 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.846387  normal  0.436059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4891  urease, gamma subunit  50.51 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3621  urease subunit gamma  52.53 
 
 		 100 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.706201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0182  urease subunit gamma  53.54 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>