More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1999 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1999  heat shock protein DnaJ  100 
 
 		 394 aa  792    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1823  heat shock protein DnaJ-like protein  65.62 
 
 		 345 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0279847  normal  0.0131214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2287  heat shock protein DnaJ domain protein  45.8 
 
 		 125 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3117  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  61.19 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  0.291751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4917  heat shock protein DnaJ, N-terminal  57.53 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34896  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5363  DnaJ domain protein  57.53 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0558  DnaJ-class molecular chaperone  61.29 
 
 		 177 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  55.07 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2078  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  43.06 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0025  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1134  chaperone protein DnaJ  46.88 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  44.74 
 
 		 384 aa  69.3  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0005  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.44 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1135  heat shock protein DnaJ-like  50 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.379333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  44.26 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1645  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0266103  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 		 355 aa  67  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 		 395 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1310  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.95 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.107849  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1276  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00131629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1286  chaperone DnaJ  40.85 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  47.54 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  45.45 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0465  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141639  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1396  chaperone protein DnaJ  42.86 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.427983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  38.03 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  42.65 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  46.15 
 
 		 330 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  46.15 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004289  chaperone protein DnaJ  49.18 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4463  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  48.39 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  47.54 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  46.97 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  46.77 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2053  chaperone protein DnaJ  44.12 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.519265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  45.16 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1249  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38744  normal  0.199724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4482  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0965  chaperone protein DnaJ  42.19 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0652035  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0198  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3220  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000114884  hitchhiker  0.0000204508 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_31961  dnaJ homolog in endoplasmic reticulum  44.78 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.108543 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  44.12 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  44.12 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  43.66 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5050  chaperone protein DnaJ  47.54 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  46.97 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2126  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.549127  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  46.77 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04511  DnaJ-like protein  49.28 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  45.16 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2042  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2059  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5925  heat shock protein DnaJ domain protein  41.43 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4805  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4415  chaperone protein DnaJ  42.62 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  48.39 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01135  chaperone protein DnaJ  45.9 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4095  chaperone protein DnaJ  42.62 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1670  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal  0.0271561 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0493  chaperone protein DnaJ  41.27 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1339  DnaJ domain-containing protein  47.54 
 
 		 86 aa  63.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.927719  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  43.42 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  40.32 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12360  chaperone protein DnaJ  50 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0467451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  41.94 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  46.77 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2999  chaperone protein DnaJ  43.55 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.905644  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  46.77 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  46.77 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1972  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  46.77 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2162  chaperone protein DnaJ  46.77 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>