46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0322 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0322  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
394 aa  771    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  56.33 
 
 
401 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1914  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
458 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.42815  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3167  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
462 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2670  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
457 aa  142  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3781  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1884  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 
461 aa  137  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  26.9 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  24.93 
 
 
401 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  24.78 
 
 
450 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4572  major facilitator transporter  23.91 
 
 
453 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.359582 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1231  major facilitator transporter  21.93 
 
 
397 aa  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  24.85 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0861  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
404 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152258  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  25.15 
 
 
396 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  28.85 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.68 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1043  major facilitator transporter  24.45 
 
 
440 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1883  major facilitator transporter  22.62 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.71782  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1653  major facilitator transporter  24.18 
 
 
388 aa  46.6  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
406 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2744  major facilitator family transporter  32.24 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3497  major facilitator transporter  24.1 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405337  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  23.33 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  27.92 
 
 
460 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  29.91 
 
 
441 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  22.8 
 
 
409 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
472 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  26.92 
 
 
444 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1865  major facilitator transporter  25.83 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  23.19 
 
 
435 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  23.35 
 
 
407 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 
385 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2241  major facilitator family transporter  24.23 
 
 
418 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113649  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  19.7 
 
 
410 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  19.21 
 
 
410 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  19.21 
 
 
410 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  19.21 
 
 
410 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0094  major facilitator transporter  27.87 
 
 
406 aa  43.1  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0031083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  19.21 
 
 
410 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1095  major facilitator transporter  29.79 
 
 
477 aa  43.1  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2454  major facilitator transporter  29.75 
 
 
389 aa  43.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>