22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1914 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2670  major facilitator superfamily MFS_1  71.79 
 
 		 457 aa  644    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1914  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 458 aa  885    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.42815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3167  major facilitator superfamily MFS_1  64.76 
 
 		 462 aa  570  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3781  major facilitator superfamily MFS_1  60.68 
 
 		 449 aa  545  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1884  major facilitator superfamily MFS_1  61.44 
 
 		 461 aa  511  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.778775  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2172  hypothetical protein  27.56 
 
 		 401 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00734692  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0322  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2949  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163593  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  20.36 
 
 		 396 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  22.17 
 
 		 376 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0717  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 402 aa  55.1  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.181007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0972  major facilitator superfamily MFS_1  20.14 
 
 		 388 aa  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000460218  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1926  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1461  major facilitator transporter  21.76 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.609311  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1324  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.654344  normal  0.651678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  31.54 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3659  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0877  major facilitator superfamily MFS_1  21.37 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.256808  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1554  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 399 aa  43.5  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 403 aa  43.1  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>