85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0277 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0277  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0882  polysaccharide deacetylase  49.66 
 
 		 308 aa  297  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.698941  hitchhiker  0.000000806635 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3699  polysaccharide deacetylase  46.58 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2979  polysaccharide deacetylase  44.18 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2557  polysaccharide deacetylase family protein  43.05 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3232  polysaccharide deacetylase  41.55 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3973  polysaccharide deacetylase  39.53 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0986666  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4593  polysaccharide deacetylase  38.64 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000328095  hitchhiker  0.00511566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1773  polysaccharide deacetylase  39.19 
 
 		 298 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1801  polysaccharide deacetylase  39.19 
 
 		 298 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1863  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6216  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1887  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.65071  hitchhiker  0.000000465895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5164  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0922  polysaccharide deacetylase  39.13 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.603398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2390  putative polysaccharide deacetylase  38.8 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192005  normal  0.179282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1410  polysaccharide deacetylase  38.85 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.257761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1797  polysaccharide deacetylase  38.8 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1193  polysaccharide deacetylase  38.31 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0326614  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1318  hypothetical protein  37.97 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1254  polysaccharide deacetylase  37.97 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0013  polysaccharide deacetylase family protein  38.51 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478406  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1884  polysaccharide deacetylase family protein  38.51 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1156  polysaccharide deacetylase family protein  38.51 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.540807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2279  polysaccharide deacetylase family protein  38.51 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0430  polysaccharide deacetylase  38.82 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2189  polysaccharide deacetylase family protein  37.84 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2405  polysaccharide deacetylase family protein  38.51 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.498763  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1394  polysaccharide deacetylase family protein  38.51 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2241  polysaccharide deacetylase family protein  38.51 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1416  polysaccharide deacetylase  38.05 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1834  polysaccharide deacetylase  37.62 
 
 		 301 aa  198  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2609  hypothetical protein  37.29 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1728  polysaccharide deacetylase  37.29 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0436  polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2157  polysaccharide deacetylase  37.87 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0923  polysaccharide deacetylase  36.24 
 
 		 305 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4018  polysaccharide deacetylase  36.21 
 
 		 299 aa  185  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.745144  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2551  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35.81 
 
 		 296 aa  185  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1402  polysaccharide deacetylase  35.81 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1393  polysaccharide deacetylase  35.81 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02141  hypothetical protein  35.81 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2401  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35.81 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02182  hypothetical protein  35.81 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3397  polysaccharide deacetylase domain protein  35.81 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4227  polysaccharide deacetylase  36 
 
 		 299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2632  polysaccharide deacetylase domain protein  35.81 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1353  polysaccharide deacetylase  35.91 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2692  polysaccharide deacetylase  37.33 
 
 		 293 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145511  normal  0.370687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2410  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35.47 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2925  polysaccharide deacetylase  35.55 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2436  polysaccharide deacetylase  36.82 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2540  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.82 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  normal  0.731113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2485  polysaccharide deacetylase domain protein  36.82 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2644  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  36.82 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2528  polysaccharide deacetylase domain protein  36.49 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2844  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 294 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0804894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18340  hypothetical protein  36.77 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1590  hypothetical protein  37.11 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2076  polysaccharide deacetylase  33.89 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  27.56 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  26.92 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  23.56 
 
 		 241 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  27.22 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  24.35 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  24.35 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  23.91 
 
 		 293 aa  45.8  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  24.04 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  27.11 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  28.74 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  24.78 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  29.52 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  23.85 
 
 		 368 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  28.15 
 
 		 233 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  24.72 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  27.69 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  27.69 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>