21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2366 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  100 
 
 		 383 aa  738    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0561  hypothetical protein  50.83 
 
 		 416 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2323  hypothetical protein  49.15 
 
 		 414 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566369  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0670  hypothetical protein  48.1 
 
 		 415 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0972  CheA signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1110  hypothetical protein  52.7 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00592448  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  31.4 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  31.4 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0818  hypothetical protein  44.44 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0544708  hitchhiker  0.00523274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0973  hypothetical protein  34.65 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0416255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  31.75 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.33 
 
 		 2449 aa  57.4  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  28.97 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  26.67 
 
 		 356 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  27.62 
 
 		 3472 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  28.87 
 
 		 277 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0974  hypothetical protein  27.87 
 
 		 433 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0162438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  30.33 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  29.01 
 
 		 314 aa  43.5  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  31.19 
 
 		 379 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  32.43 
 
 		 381 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>