35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1115 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  345  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  66.91 
 
 		 134 aa  168  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  51.75 
 
 		 124 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  56.6 
 
 		 144 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  51.75 
 
 		 124 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  52.25 
 
 		 124 aa  90.9  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1881  hypothetical protein  45.95 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  35.07 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  35.29 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  34.23 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  27.34 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  32.05 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  34.41 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  34.18 
 
 		 123 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  26.62 
 
 		 125 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  29.92 
 
 		 119 aa  51.2  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  31.86 
 
 		 119 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  26.52 
 
 		 127 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  32.86 
 
 		 121 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  36.07 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  31.82 
 
 		 121 aa  47.8  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  31.82 
 
 		 121 aa  47.8  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  32.43 
 
 		 127 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  36.49 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  23.91 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  29.01 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  32.97 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  31.71 
 
 		 123 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  31.71 
 
 		 123 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  30.77 
 
 		 136 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  27.88 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  31.71 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  35.11 
 
 		 100 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  36 
 
 		 113 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>