30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1999 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1999  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  640    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1054  hypothetical protein  41.64 
 
 		 333 aa  198  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.974615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2127  hypothetical protein  42.86 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0320  hypothetical protein  44.09 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2236  endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 373 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2757  endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 330 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2143  endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1495  hypothetical protein  41.13 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00771781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6087  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4196  endoribonuclease L-PSP  41.2 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.165423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2676  endoribonuclease L-PSP  42.26 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.998164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2809  endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 430 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2762  hypothetical protein  38.35 
 
 		 353 aa  162  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0789  dioxygenase, putative  40.26 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1331  hypothetical protein  41.92 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0932  Endoribonuclease L-PSP  40.26 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.716566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2681  Endoribonuclease L-PSP  41.81 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0232288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2072  pteridine-dependent deoxygenase  35.4 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1994  putative pteridine-dependent deoxygenase like protein  34.67 
 
 		 326 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.104515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03739  xanthomonadin biosynthesis pteridine-dependent deoxygenase like protein  38.76 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3784  hypothetical protein  34.09 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0804  endoribonuclease L-PSP  28.64 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1292  Endoribonuclease L-PSP  28.78 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.849013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 147 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1932  Endoribonuclease L-PSP  26.69 
 
 		 362 aa  50.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.375658  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  27.43 
 
 		 128 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 135 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0460  endoribonuclease L-PSP  28.21 
 
 		 140 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  28.95 
 
 		 124 aa  42.7  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>