36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0477 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  31.82 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  30.06 
 
 		 202 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  30.5 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  30.46 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  30 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  29.05 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  29.05 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  31.06 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  30.12 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  29.81 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  27.95 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  28.87 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  29.45 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  29.81 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  31.98 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  30.06 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  24.38 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  24.71 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  24.71 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  22.73 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  23.95 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  29.25 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  30.22 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  25 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  25 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  27.03 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  23.65 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  22.46 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  27.56 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  22.3 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.63 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  27.56 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.08 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  25.78 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>