More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1213 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1213  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  55.7 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2526  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.95 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.33 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.37 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.7 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.51 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.33 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.06 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.95 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.74 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.35 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.95 
 
 		 138 aa  118  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.39 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.39 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.79 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.87 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.31 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.58 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.71 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.38 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.1 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4152  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.14 
 
 		 176 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.06 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1387  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.86 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.25 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.91 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.93 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  38.06 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1654  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.75 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.71 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.85 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.42 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.74 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  38.99 
 
 		 155 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.58 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  40.65 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  34.94 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.72 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  38.96 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.36 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  36.31 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  36.31 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.44 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.47 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  35.71 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.1 
 
 		 137 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.12 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.76 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.58 
 
 		 136 aa  97.1  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.1 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  35.71 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  32.93 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  35.71 
 
 		 147 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  35.71 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  36.42 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  38.16 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  36.84 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  35.71 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  34.13 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  37.5 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.75 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  34.87 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  36.36 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  36.36 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.26 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  35.26 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  32.93 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1561  flagellar basal body rod protein FlgC  36.24 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1820  flagellar basal body rod protein FlgC  36.91 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  34.21 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1710  flagellar basal body rod protein FlgC  36.24 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2557  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.21 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0110618  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  34.21 
 
 		 138 aa  91.3  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1396  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.21 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00396064  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0692  flagellar basal body rod protein FlgC  35.54 
 
 		 167 aa  90.9  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1764  flagellar basal body rod protein FlgC  34.9 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2461  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.21 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0105073  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  36.49 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.1 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  34.21 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1357  flagellar basal body rod protein FlgC  32.21 
 
 		 137 aa  90.1  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3635  flagellar basal body rod protein FlgC  35.57 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1558  flagellar basal body rod protein FlgC  35.57 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.110702  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1532  flagellar basal body rod protein FlgC  35.57 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.123411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1521  flagellar basal body rod protein FlgC  35.57 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1675  flagellar basal body rod protein FlgC  35.57 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.44 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.45 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1742  flagellar basal body rod protein FlgC  35.57 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31240  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.76 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.652275  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3955  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.67 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0794  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.32 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.34 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2269  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.06 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.11 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  34.69 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>