268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0794 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0794  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 
166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.62 
 
 
146 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.88 
 
 
147 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.49 
 
 
147 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.13 
 
 
145 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  35.33 
 
 
164 aa  101  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.13 
 
 
145 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.46 
 
 
141 aa  99  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  36.36 
 
 
164 aa  97.8  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.98 
 
 
163 aa  97.4  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.19 
 
 
142 aa  97.1  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.9 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  35.22 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.82 
 
 
146 aa  94  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.88 
 
 
145 aa  94  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.65 
 
 
146 aa  94  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.97 
 
 
147 aa  93.6  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.62 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  34.16 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.85 
 
 
137 aa  93.6  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.27 
 
 
145 aa  93.6  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  34.59 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.66 
 
 
145 aa  93.2  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.38 
 
 
150 aa  92  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  34.59 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0692  flagellar basal body rod protein FlgC  35.19 
 
 
167 aa  91.7  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  34.55 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.73 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.75 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  35 
 
 
145 aa  89  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  34.52 
 
 
152 aa  88.6  4e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  39.38 
 
 
155 aa  88.2  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.62 
 
 
145 aa  87.8  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.96 
 
 
138 aa  87.4  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.62 
 
 
145 aa  87.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1213  flagellar basal body rod protein FlgC  32.32 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.85 
 
 
140 aa  86.3  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.85 
 
 
140 aa  86.3  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.4 
 
 
146 aa  85.5  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.78 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.33 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.26 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.63 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1654  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.56 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105291  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.14 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  30.25 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.87 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1357  flagellar basal body rod protein FlgC  30 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  32.72 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  28.4 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  29.63 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  33.96 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  30.25 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  30.25 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  30.25 
 
 
141 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.94 
 
 
143 aa  79  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  30.25 
 
 
141 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  30.63 
 
 
138 aa  79  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  30.25 
 
 
141 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  30.25 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  30.25 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  30.25 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  30.25 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  30.25 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  30.25 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  30.25 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  29.81 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  33.95 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  33.95 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  30.63 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  32.1 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  34.18 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  34.18 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.48 
 
 
137 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  31.25 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  28.4 
 
 
141 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  31.25 
 
 
147 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2526  flagellar basal-body rod protein FlgC  36 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  29.52 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  33.13 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  28.75 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.65 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  30 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.01 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  31.45 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4152  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.39 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  38.31 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  38.31 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  30.43 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  29.19 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2461  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.87 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0105073  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  31.87 
 
 
138 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.38 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  30.38 
 
 
146 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  26.88 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  30.43 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1396  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.25 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00396064  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.95 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2557  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.25 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0110618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>