269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3955 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3955  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 
137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.22 
 
 
145 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.84 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.99 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.99 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.67 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.39 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.97 
 
 
145 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.03 
 
 
147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.27 
 
 
140 aa  106  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.46 
 
 
146 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.58 
 
 
146 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.19 
 
 
149 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.5 
 
 
147 aa  103  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  38.1 
 
 
150 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  37.41 
 
 
150 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.85 
 
 
145 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.38 
 
 
141 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.56 
 
 
150 aa  100  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.44 
 
 
140 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.19 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.82 
 
 
146 aa  98.2  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2526  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.06 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.11 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.55 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  38.62 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.97 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  39.26 
 
 
134 aa  94.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.74 
 
 
163 aa  94.7  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.06 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.44 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.07 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  36.3 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.3 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4152  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.67 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  36.3 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  36.3 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  36.3 
 
 
134 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  37.74 
 
 
164 aa  92  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  36.3 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1654  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.55 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105291  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  36.3 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.92 
 
 
142 aa  92  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  36.3 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  36.3 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.23 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.23 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.01 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  35.56 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  35.56 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  35.56 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.15 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  35.56 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  35.56 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  37.11 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  40.74 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.97 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.03 
 
 
139 aa  90.5  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.42 
 
 
135 aa  90.5  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.68 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.14 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.07 
 
 
135 aa  89.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  37.11 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1213  flagellar basal body rod protein FlgC  36.67 
 
 
151 aa  89  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  34.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  34.81 
 
 
134 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.31 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1357  flagellar basal body rod protein FlgC  37.41 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.21 
 
 
137 aa  88.2  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  36.3 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  33.74 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.77 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  36.3 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  36.3 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.31 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.81 
 
 
136 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.07 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  36.48 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  37.31 
 
 
137 aa  86.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.3 
 
 
134 aa  87  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  32.72 
 
 
166 aa  86.7  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.56 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  34.07 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1561  flagellar basal body rod protein FlgC  35.97 
 
 
137 aa  84.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.78 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.15 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  34.78 
 
 
141 aa  84  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  34.81 
 
 
134 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  35.29 
 
 
144 aa  84  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  34.81 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  32.28 
 
 
164 aa  83.6  8e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.56 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.56 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  36.57 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1710  flagellar basal body rod protein FlgC  35.25 
 
 
137 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.59 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.33 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.3 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1532  flagellar basal body rod protein FlgC  35.25 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.123411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>