181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0119 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0119  flagellar protein FliS  100 
 
 
146 aa  294  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.759612  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1487  flagellar protein FliS  43.09 
 
 
145 aa  101  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0441  flagellar protein FliS  37.8 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.906656  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17030  flagellar protein FliS  42.74 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0557  flagellar protein FliS  38.13 
 
 
136 aa  90.1  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00232757  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0106  flagellar protein FliS  46.61 
 
 
134 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0288996  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0827  flagellar protein FliS  36.05 
 
 
154 aa  87  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1574  flagellar protein FliS  38.33 
 
 
137 aa  84  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1640  flagellar protein FliS  37.5 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3014  flagellar protein FliS  39.83 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.896299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3200  flagellar protein FliS  37.8 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0560  flagellar protein FliS  35.71 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0232  flagellin-specific chaperone FliS-like protein  38.4 
 
 
168 aa  82  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000726732  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1652  flagellar protein FliS  42.74 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0313  flagellar protein FliS  34.92 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0465  flagellar protein FliS  45.13 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000775851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0766  flagellar protein FliS  32.37 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049999 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2521  flagellar protein FliS  40.68 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00148899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0667  flagellar protein FliS  41.53 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1593  flagellar protein FliS  40.87 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1537  flagellar protein FliS  38.69 
 
 
135 aa  77  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5255  flagellar protein potentiates polymerization, flagellar protein FliS  38.35 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0356496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0529  flagellar protein FliS  39.2 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0255  flagellar protein FliS  37.7 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2228  flagellar protein FliS  33.59 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000248624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1111  flagellar protein FliS  35.43 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2589  flagellar protein FliS  34.65 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2572  flagellar protein FliS  37.21 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.680491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0633  flagellar protein FliS  40.77 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0821  flagellar protein FliS  38.46 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1579  flagellar protein FliS  34.88 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2415  flagellar protein FliS  34.09 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0445  flagellar protein FliS  33.85 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1784  flagellar protein FliS  30.77 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2217  flagellar protein FliS  40.68 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2021  flagellar protein FliS  38.26 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2383  flagellar protein FliS  38.26 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2284  flagellar protein FliS  38.26 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4165  flagellar protein FliS  30.88 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0033  flagellar protein FliS  34.19 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2120  flagellar protein FliS  36.29 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.472713  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1119  flagellar protein FliS  37.9 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.8663  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2890  flagellar protein FliS  36.03 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2524  flagellar protein FliS  33.58 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2929  flagellar protein FliS  39.29 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1978  flagellar protein FliS  34.53 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1291  hypothetical protein  37.3 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2973  flagellar protein FliS  38.26 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126092  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5092  flagellar protein FliS  38.41 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3059  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895384  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3036  flagellar protein FliS  32.2 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3107  flagellar protein FliS  38.26 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0168  flagellar protein FliS  36.04 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.390795 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24260  flagellar protein FliS  34.13 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03167  flagellar protein FliS  34.71 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002810  flagellar biosynthesis protein FliS  35.54 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1290  hypothetical protein  36.51 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3768  flagellar protein FliS  35.14 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889276 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00999  flagellar protein FliS  32.85 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00828362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2387  flagellar protein FliS  34.4 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4093  flagellar protein FliS  32.82 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06167  flagellar protein FliS  32.85 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1340  flagellar protein FliS  36.52 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179447  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1983  flagellar protein FliS  37.5 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2123  flagellar protein FliS  36.52 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0665218  hitchhiker  0.000000706832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1282  flagellar protein FliS  36.52 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299336  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2176  flagellar protein FliS  36.52 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.011809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2118  flagellar protein FliS  36.52 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0995  flagellar protein FliS  34.19 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1159  flagellar protein FliS  36.52 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0677314  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1012  flagellar protein FliS  31.71 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3283  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0419  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0555717  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6411  flagellar protein FliS  36.52 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.168553 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1894  flagellar protein FliS  32.56 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2948  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2140  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0224  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.204088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0236  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3398  flagellar protein FliS  35.65 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2352  flagellar protein FliS  28.46 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0620  flagellar protein FliS  34.56 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2313  flagellar protein FliS  32.23 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2942  flagellar protein FliS  32.56 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.668615  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2911  flagellar protein FliS  37.1 
 
 
275 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.132531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0781  flagellar protein FliS  31.3 
 
 
135 aa  60.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1722  flagellar protein FliS  33.88 
 
 
136 aa  60.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3081  flagellar protein FliS  33.91 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2448  flagellar protein FliS  33.91 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3062  flagellar protein FliS  33.91 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650828  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1448  flagellar protein FliS  30.95 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0836  flagellar protein FliS  31.75 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289358  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1361  flagellar protein FliS  34.21 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3084  flagellar protein FliS  33.08 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.933377  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2032  flagellar protein FliS  33.91 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294814  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4748  flagellar protein FliS  37.21 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.304458 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3671  flagellar protein FliS  37.21 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3810  flagellar protein FliS  29.63 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2864  flagellar protein  30.58 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.870438  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2931  flagellar protein FliS  30.7 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.991604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>