32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0345 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0345  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  671    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  29.36 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  29.36 
 
 		 254 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5737  hypothetical protein  32.14 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310215  normal  0.993413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3532  hypothetical protein  30.04 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0756  hypothetical protein  30.18 
 
 		 222 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1008  hypothetical protein  28.89 
 
 		 221 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  26.99 
 
 		 221 aa  79  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0601  lipase, putative  26.5 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.267926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1332  hypothetical protein  26.17 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2648  hypothetical protein  25.81 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.549613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  25.87 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  26.61 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1076  PGAP1 family protein  25.86 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3773  PGAP1 family protein  25.23 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0618  hypothetical protein  26.52 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  28.05 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3354  acetyltransferases and hydrolases with the alpha/beta hydrolase fold-like  27.73 
 
 		 241 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  25.69 
 
 		 216 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  25.35 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0537  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  24.77 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.319517  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1690  hypothetical protein  25.23 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00126399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0515  hypothetical protein  26.82 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  24.22 
 
 		 249 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1762  hypothetical protein  23.81 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.88395  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2277  hypothetical protein  21.49 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0546  acetyltransferase/hydrolase  27.74 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338996  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2238  hypothetical protein  21.56 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  27.64 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1595  putative lipoprotein  26.58 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.146159  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05312  cob(I)alamin adenosyltransferase  24.02 
 
 		 205 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0802  hypothetical protein  18.72 
 
 		 240 aa  42.4  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.946026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>