More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0294 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0294  signal recognition particle  100 
 
 		 448 aa  917    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  46.87 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  46.64 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  44.34 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  47.21 
 
 		 512 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  44.71 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.28 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  46.54 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  46.44 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  46.44 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  44.42 
 
 		 492 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  45.32 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  44.13 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  44.7 
 
 		 463 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.19 
 
 		 512 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  44.78 
 
 		 479 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.26 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  43.22 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  45.05 
 
 		 448 aa  363  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.76 
 
 		 447 aa  362  7.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  44.16 
 
 		 450 aa  361  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  43.08 
 
 		 443 aa  361  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  45.37 
 
 		 453 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  45.37 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  45.37 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  45.37 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  45.37 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  45.37 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  45.37 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  45.37 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  44.17 
 
 		 456 aa  360  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  45.37 
 
 		 453 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  43.56 
 
 		 518 aa  360  4e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  42.52 
 
 		 449 aa  360  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  44.44 
 
 		 493 aa  358  8e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  42.72 
 
 		 442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  42.69 
 
 		 446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  44.24 
 
 		 444 aa  355  8.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  43.65 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  43.32 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  42.41 
 
 		 449 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  42.82 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.54 
 
 		 511 aa  353  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  42.52 
 
 		 449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  42.52 
 
 		 449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  42.52 
 
 		 449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  42.52 
 
 		 449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  42.52 
 
 		 449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  42.29 
 
 		 449 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  42.44 
 
 		 451 aa  353  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  42.29 
 
 		 449 aa  353  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2643  signal recognition particle protein  43.27 
 
 		 455 aa  352  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  42.29 
 
 		 449 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  42.29 
 
 		 449 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  41.2 
 
 		 455 aa  351  1e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0244  signal recognition particle protein  42.38 
 
 		 450 aa  351  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450094  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  42.28 
 
 		 515 aa  351  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  44.42 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  44.42 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  44.66 
 
 		 453 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  44.42 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  42.29 
 
 		 449 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  44.42 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  44.42 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  43.05 
 
 		 453 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2134  signal recognition particle protein  42.6 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  42.2 
 
 		 515 aa  349  5e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  42.22 
 
 		 508 aa  349  5e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  43.24 
 
 		 451 aa  349  7e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  42.98 
 
 		 443 aa  348  9e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  40.76 
 
 		 455 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  40.76 
 
 		 455 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  43.43 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05915  signal recognition particle protein  42 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.2 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3017  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.68 
 
 		 474 aa  346  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0662869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  43.65 
 
 		 453 aa  345  7e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2793  signal recognition particle protein  42.42 
 
 		 455 aa  345  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  41.7 
 
 		 445 aa  345  1e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.26 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  43.43 
 
 		 453 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.21 
 
 		 452 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.79 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  42.45 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2514  signal recognition particle protein  41.98 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1295  signal recognition particle protein  41.98 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3515  signal recognition particle protein  41.98 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3479  signal recognition particle protein  41.98 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3268  signal recognition particle protein  41.98 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3517  signal recognition particle protein  41.98 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0436  signal recognition particle protein  41.98 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0518  signal recognition particle protein  41.98 
 
 		 455 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.034328  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0493  signal recognition particle protein  41.98 
 
 		 455 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  42.96 
 
 		 463 aa  343  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  41.46 
 
 		 449 aa  343  5e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1149  signal recognition particle protein  41.98 
 
 		 455 aa  343  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543894  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3440  signal recognition particle protein  41.54 
 
 		 455 aa  343  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000127392  hitchhiker  0.000711681 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.39 
 
 		 478 aa  342  5.999999999999999e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000697976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0560  signal recognition particle protein  41.76 
 
 		 455 aa  342  8e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276011  hitchhiker  0.000299171 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.58 
 
 		 481 aa  342  8e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>